TaxonID	Class	KO.D0.FECAL.A	KO.D0.FECAL.B	KO.D0.FECAL.C	KO.D0.FECAL.D	KO.D0.FECAL.E	KO.D0.ORAL.A	KO.D0.ORAL.B	KO.D0.ORAL.C	KO.D0.ORAL.D	KO.D0.ORAL.E	KO.D10.FECAL.A	KO.D10.FECAL.B	KO.D10.FECAL.C	KO.D10.FECAL.D	KO.D10.FECAL.E	KO.D10.FECAL.F	KO.D10.FECAL.G	KO.D10.FECAL.H	KO.D10.FECAL.I	KO.D10.ORAL.A	KO.D10.ORAL.B	KO.D10.ORAL.C	KO.D10.ORAL.D	KO.D10.ORAL.E	WT.D0.FECAL.A	WT.D0.FECAL.B	WT.D0.FECAL.C	WT.D0.FECAL.D	WT.D0.FECAL.E	WT.D0.ORAL.A	WT.D0.ORAL.B	WT.D0.ORAL.C	WT.D0.ORAL.D	WT.D0.ORAL.E	WT.D10.FECAL.A	WT.D10.FECAL.B	WT.D10.FECAL.C	WT.D10.FECAL.D	WT.D10.FECAL.E	WT.D10.FECAL.F	WT.D10.FECAL.G	WT.D10.FECAL.H	WT.D10.FECAL.I	WT.D10.ORAL.A	WT.D10.ORAL.B	WT.D10.ORAL.C	WT.D10.ORAL.D	WT.D10.ORAL.E
SP10	Bacteria;Firmicutes;Erysipelotrichia	0.00545152879829343	0.0176729748673275	0.00657482780212899	0.0196263892173091	0.00388283953743564	0	0	0.00460878885316184	0	0.00135102916633553	0.00714085690282834	0.0041693552389934	0.00192667620830122	0	0.00916854403520721	0.000979619143191647	0.000594530321046373	0.00367633807893314	0.00170869362605499	0.00131752305665349	0.00550683255149908	0.0178825697294581	0.00125638005496663	0	0.00166625010414063	0.000615060188032686	0.00488249462925591	0	0.00520338219842898	0.000413907284768212	0	0	0	0.00451545675581799	0.0010509984485261	0.0660384766391834	0.00767018216682646	0.00393824826717076	0.000880211250700168	0.000258147789609551	0	0.00114942528735632	0.000294442399705558	0	0.0173824130879346	0.00367614491983347	0.00878225441376188	0.0347404730617608
SP21	Bacteria;Proteobacteria;Gammaproteobacteria	0	0	0	0.00583274217703161	0	0.0311305297651557	0.096985698569857	0.0555198285101822	0.161277118297176	0.185090995787968	0	0	0	0	0	0.00348839987575562	0	0	0	0.393164380376657	0.330264269689112	0.309824943462602	0.361955241460542	0.392176647268631	0	0	0	0.000239348970799426	0.00280182118376945	0.229304635761589	0.0952580122340147	0.101091823108947	0.169818967846528	0.0459360889197638	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.395668685209894	0.342024539877301	0.370271946142262	0.301765504753282	0.41470926412615
SP33	Bacteria;Spirochaetes;Spirochaetia	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.00280744247495321	0	0.00571069314192906	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.0173974167472103	0.00598919341188725	0	0	0	0	0	0	0	0	0.0150765606595995	0.00727069351230425	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
SP36	Bacteria;Actinobacteria;Coriobacteriia	0.0109030575965869	0.00871132472213878	0.00876643706950532	0.0131630803184362	0.00903182240229594	0	0	0.00192926045016077	0	0.00111261225462926	0.00665079809577149	0.00670074949123939	0.00748651326654189	0	0.00696809346675748	0.00485030941629035	0.00371581450653983	0.00504595422598666	0.00409050898358619	0.000697512206463613	0.000670143643833222	0.00230337549208476	0.0060855908912446	0.000375445841937301	0.00562359410147463	0.00448115279852386	0.00266909706399323	0.00435615126854955	0.00210136588782709	0.000827814569536424	0	0	0	0.000955192775269191	0.00135128371953356	0.00455437769925402	0.00311601150527325	0.00661625708884688	0.00744178602864688	0.0069054533720555	0.00227221086116792	0.000731452455590387	0.000736105999263894	0.000615826747408396	0.00153374233128834	0.00155018159270086	0.0022181982797646	0.00328515111695138
SP39	Bacteria;Firmicutes;Mollicutes	0.00865133917990045	0.000250325423049965	0.00814026299311208	0	0.00232126276694522	0	0	0	0	0.000715250735118811	0.00161019322318678	0.00258102943366258	0.00297258614995046	0	0.00508199297951485	0	0.0045332936979786	0.000252297711299333	0	0	0	0	0	0	0	0.0329496529303225	0.0453746500878849	0	0.000300195126832441	0	0	0	0	0.000781521361583883	0	0.00337652139772281	0.0161393416426973	0.0122085696282294	0	0.00948693126815102	0.000568052715291979	0.000940438871473354	0	0	0	0	0.000271616115889543	0
SP41	Bacteria;Actinobacteria;Actinobacteria	0.0234652761317848	0.0332432161810353	0.0251252348152786	0	0	0	0	0	0	0	0.00560067208064968	0.0164292450488907	0.00600022019156666	0	0.0129407450096925	0	0	0	0	0.000620010850189878	0.000437050202499927	0.00180082083926627	0	0.000234653651210813	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
SP43	Bacteria;Actinobacteria;Actinomycetia	0	0	0	0	0	0.0124249044238121	0.00334433443344334	0.00128617363344051	0.00294719607040524	0.0015894460780418	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.000620010850189878	0.000524460242999913	0.000376915989613871	0.00113859442481351	0.000469307302421626	0	0	0	0	0	0.00413907284768212	0.00162074554294976	0.00047129055062446	0	0.00164987843001042	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.000650678564788994	0	0	0.00073915900131406
SP5	Bacteria;Firmicutes;Erysipelotrichi	0.0760843801848779	0.132021628116552	0.0856293049467752	0	0.0700599307841648	0.00122883670125614	0	0.0111468381564845	0	0.00596042279265676	0.285494259311117	0.198094009033603	0.0900583507651657	0	0.0511342798763556	0	0.234616527942925	0.06433591638133	0.0180707295603997	0.0294505153840192	0.0485125724774919	0.0247089370969093	0.0147232037691402	0.00159564482823353	0.183995667749729	0.257446621562253	0.319380248681726	0.264097654380086	0.160604392855356	0.00434602649006622	0.000679667485753124	0	0.00716022696568495	0.011028134769017	0.278364446223913	0.168826069886141	0.459491850431448	0.1955734089477	0.00288069136592782	0.00232333010648596	0.00681663258350375	0.145872518286311	0.0774383511225616	0.0216565739505286	0.0371351552333147	0.0496943927717247	0.0174739701222273	0.0427069645203679
SP75	Bacteria;Verrucomicrobia;Verrucomicrobiae	0.0120881725527376	0.0476619605487133	0.0103318722604884	0.00228580436667455	0	0	0	0.00267952840300107	0	0.000635778431216721	0.104872584710165	0.287784781853378	0	0	0.38759365012836	0	0.185790725326992	0	0	0	0	0.000125638663204624	0	0	0.0636924102307756	0	0	0.105169937769268	0.312653224595987	0	0	0	0	0	0.17021170111606	0	0	0	0.0773785708570057	0.345724427234592	0.310611224721654	0.201358411703239	0.368936326831064	0	0	0	0	0
SP9	Bacteria;Firmicutes;Bacilli	0.090542782649917	0.229248022429158	0.0929868503443957	0.249625601008907	0.32392166793281	0.943336974330967	0.897469746974698	0.772132904608789	0.833729021694638	0.567273305253119	0.294035284234108	0.232689730480965	0.101508312231642	0.0338624338624339	0.0870749724943679	0.571595823477409	0.181108799048751	0.324058388898901	0.436234660591312	0.568627450980392	0.578800151510737	0.599882737247676	0.385198272477424	0.395790313497278	0.211155544447222	0.116246375538178	0.220167957815246	0.178697941598851	0.053334667533897	0.608236754966887	0.902284728394416	0.898436886340429	0.812888408538233	0.811306009030914	0.203042890746209	0.397173144876325	0.145174177053372	0.125157529930687	0.110906617588221	0.0784123910939013	0.15223812769825	0.233751306165099	0.201913875598086	0.580519347223648	0.586493772076594	0.55235184693064	0.627478497057492	0.495934625492773
SP92	Bacteria;Bacteroidetes;Flavobacteriia	0	0	0	0	0	0	0	0	0.000409332787556283	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.0237141735374951	0.0179510043176272	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.0166976702985207	0.0217745586238117	0
SP93	Bacteria;Proteobacteria;Epsilonproteobacteria	0.0357904716757525	0.0103634725142685	0.0398403256105197	0.0235674312288169	0.00109732421710138	0.00232113599126161	0.000176017601760176	0.015005359056806	0	0.012318207104824	0.00119014281713806	0.0045664366903261	0.106407574589893	0	0.0103211609996333	0.00470695051728669	0.00200653983353151	0.0036042530185619	0.000983793299849842	0	5.82733603333236e-05	0	0	0	0.00853953178372074	0.0438450048326158	0.00546839398476662	0.0713738630923887	0.00380247160654425	0.0149006622516556	0	0	0	0.0035602639805488	0.00530503978779841	0.00903023164507263	0.0499360818152764	0.0293005671077505	0.0771385132431784	0.0783478541464989	0.0635082935696433	0.0151515151515152	0.0101582627898417	0	0	0	0	0
SPN109	Bacteria;Bacteroidetes;Bacteroidia	0.335743067077507	0.308551116451387	0.322714464621165	0.353905572633404	0.42711234911792	0.00491534680502458	0.000748074807480748	0.0415862808145766	0.00163733115022513	0.0473654931256457	0.207434892187062	0.147466123988683	0.232742485962788	0.487830687830688	0.144548645675067	0.340023415286837	0.261964922711058	0.429446747161651	0.405374618132864	0.000697512206463613	0.0141021532006643	0.0157467124549795	0.192108362779741	0.189271635066642	0.322002832625177	0.26430014937176	0.244840830675086	0.264719961704165	0.288937809576225	0.011796357615894	0	0	0.000540394487976223	0.0252691906912122	0.210499974976227	0.190420102080879	0.172099712368169	0.305135475740391	0.466271905257262	0.369474023878671	0.297546012269939	0.282236154649948	0.234376150165624	0	0.00525190555865403	0.00172734520329524	0.006337709370756	0.00332621550591327
SPN135	Bacteria;Bacteroidota;Bacteroidia	0.102156909220194	0.0935215780514669	0.100500939261115	0.0966343501221723	0.0551616442981345	0.000819224467504096	8.8008800880088e-05	0.00514469453376206	0	0.00993403798776126	0.0320638476617194	0.0377227378766069	0.105471760431575	0.213756613756614	0.0731387855608529	0.0260913196186653	0.0428061831153389	0.0512164353937646	0.0646714648164449	0.00286755018212819	0.0146848868039976	0.0150347600301533	0.00239497447978013	0.000703960953632439	0.0932266933266683	0.0521922502416308	0.069461623592214	0.0264241263762566	0.0829539200480312	0.00455298013245033	0	0	0.000810591731964334	0.00573115665161514	0.0391371803213052	0.0756968983117393	0.0438638542665388	0.0957781978575929	0.108265983836121	0.052081316553727	0.0360145421495115	0.0523510971786834	0.0409274935590725	0.00102637791234733	0.00576315300241681	0.000354327221188768	0.00769578995020371	0.00279237844940867
SPN159	Bacteria;Proteobacteria;Betaproteobacteria	0.00497748281583314	0.00370481626113948	0.00626174076393237	0.0109560967919918	0.000844095551616443	0	0	0	0	0.000635778431216721	0.00952114253710445	0.00213431280091329	0.00462402289992293	0.00634920634920635	0.00502960129931367	0.00640336415549662	0.00193222354340071	0.00191025409983781	0.0063687671516595	0	0	0	0	0	0.00166625010414063	0.000878657411475266	0.00260399713560315	0.00138822403063667	0.000650422774803622	0	0	0	0	0.000607849947898576	0	0.00471142520612485	0.00103867050175775	0.00708884688090737	0.00576138273185565	0	0	0.000626959247648903	0	0.000513188956173663	0	0	0	0
SPN218	Bacteria;Bacteroidetes;Bacteroidetes_[C-1]	0.0178952358378763	0.00490637829177931	0.019724483406387	0.0187593599747773	0.00928505106778087	0	0	0.000643086816720257	0	0.00230469681316061	0.00350042005040605	0.00382190896907728	0.0404602003743257	0.247619047619048	0.0107926861214439	0.0012902300910329	0.0122621878715815	0.00609118760136962	0.0115466266245534	0	0	0	7.85237534354142e-05	0	0.0132050320753145	0.0136191898778666	0.00514289434281622	0.0012924844423169	0.00175113823985591	0.00124172185430464	0	0	0	0.000955192775269191	0.00110104599369401	0.00180604632901453	0.0056727388942154	0.0135475740390674	0.0134432263743298	0.00316231042271701	0.00340831629175187	0	0.000736105999263894	0	0.000185908161368284	0	0	0
SPN280	Bacteria;Saccharibacteria_(TM7);Saccharibacteria_(TM7)_[C-1]	0.00545152879829343	0.00170221287673976	0.00720100187852223	0	0.00312315354098084	0	0	0	0	0.000476833823412541	0.00476057126855223	0.00173723134958058	0.00957833314984036	0	0.00387698433488762	0	0	0.00252297711299333	0	0	0	0	0	0	0.000458218778638674	0.00834724540901502	0.00592409348349717	0.000239348970799426	0	0	0	0	0	0.000347342827370615	0.00575546769430959	0.0038476639183353	0.00351550015979546	0.00606490233144297	0.00120028806913659	0.00135527589545015	0	0.00135841170323929	0	0	0	0	0	0
SPN324	Bacteria;Deferribacteres;Deferribacteres	0.0493007821758711	0.00175227796134975	0.0539292423293676	0	0	0	0	0.0090032154340836	0	0.0023841691170627	0	0.000943068446915174	0.037322470549378	0.00846560846560847	0.0384554932676691	0	0	0.000576680482969905	0	0	0	0.000125638663204624	0	0	0	0.0304015464370442	0.0039710956317948	0.00569650550502633	0	0	0.000156846342866105	0	0.000540394487976223	0.00173671413685307	0	0.000628190027483314	0.0241291147331416	0.00677378701953371	0.046731215491718	0.00354953210713133	0.00772551692797092	0	0	0	0.000185908161368284	0	0	0
SPN350	Bacteria;Proteobacteria;Alphaproteobacteria	0	0.000550715930709923	0	0	0.000211023887904111	0	0	0	0	0	0	0	0.000605526808323241	0	0	0	0	0.00176608397909533	0.000258892973644695	0	0	0	0	0	0.000416562526035158	0	0.00162749820975197	0	0.00410266673337669	0	0	0	0	0	0	0	0.000479386385426654	0	0.00168040329679123	0.000709906421426267	0	0.000940438871473354	0.000588884799411115	0	0	0	0	0
SPN366	Bacteria;Firmicutes;Clostridia	0.178478312396302	0.100730950235306	0.179242329367564	0.182154961771892	0.087574913480206	0.00382304751501912	0.00118811881188119	0.0736334405144694	0	0.159024080108082	0.0325539064687763	0.0496848165980047	0.18842893317186	0.00211640211640212	0.118090847173469	0.039136979427998	0.0648781212841855	0.0985402775274824	0.0488789934241185	0.00193753390684337	0.00521546574983246	0.0108468045899992	0.00797016097369454	0.00126712971653839	0.0925185370324086	0.151304806256041	0.0593060347633618	0.0745332695069411	0.0751988792715265	0.118584437086093	0	0	0.0082410159416374	0.0844043070510594	0.0781742655522747	0.0551236749116608	0.0587248322147651	0.18312854442344	0.0328878930943426	0.0294288480154889	0.097591456487162	0.0574712643678161	0.055576002944424	0	0.00339282394497118	0.00367614491983347	0.00434585785423268	0.00176576872536137
SPN43	Bacteria;Proteobacteria;Deltaproteobacteria	0.0419530694477364	0.00405527185340943	0.0309956167814652	0.0224639394655947	0.00637292141470414	0	0	0.00428724544480171	0	0.00150997377413971	0.00357042845141417	0.00347446269916117	0.0341296928327645	0	0.023052339288521	0.000716794495018278	0.00379013079667063	0.00666786808433952	0.00181225081551287	0	0.0012237405669998	0.00134014574084932	0.00337652139772281	0.000164257555847569	0.00124968757810547	0.00500834724540901	0.000911398997461103	0.000622307324078506	0.00130084554960724	0.00165562913907285	0	0	0	0.000781521361583883	0.000950903358190281	0.00369061641146447	0.00143815915627996	0.00701008191556396	0.044490677762663	0.0178767344304614	0.0201090661213361	0.00135841170323929	0.00456385719543614	0	0	0	0.00185604345857854	0
SPPN6	Bacteria;Cyanobacteria;Gloeobacteria	0.00106660346053567	0.00135175728446981	0.00203506574827802	0.00102467092299204	0	0	0	0.00139335476956056	0	0.000317889215608361	0	0	0.0274688979412089	0	0.00702048514695866	0.000716794495018278	0	0.000288340241484952	0	0	0	0	0	0	0.000583187536449221	0.000966523152622792	0.00227849749365276	0.00114887505983724	0.00430279681793166	0	0	0	0	0.000434178534213268	0.00505480206195886	0	0.000239693192713327	0.00267800882167612	0.0026406337521005	0.00090351726363343	0.00159054760281754	0.00470219435736677	0.00375414059624586	0	0	0	0	0