taxon lfc_(Intercept) lfc_GroupF3 se_(Intercept) se_GroupF3 W_(Intercept) W_GroupF3 p_(Intercept) p_GroupF3 q_(Intercept) q_GroupF3 diff_(Intercept) diff_GroupF3 passed_ss_(Intercept) passed_ss_GroupF3 Roseburia -0.433926100662276 0.345936281191012 0.19570477279352 0.328663867128962 -2.21724843226023 1.05255343160455 0.113333235407573 0.36983737015742 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Subdoligranulum -0.404154878170821 0.0579135930810188 0.40335669301075 0.487888789393328 -1.00197885686268 0.118702446828164 0.421888821727531 0.916358809551765 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Faecalibaculum -1.91821548809619 3.52821297381656 0.920420733896227 0.983976881656208 -2.0840637519933 3.58566653301646 0.0668235054745596 0.00587845274461154 1 0.352707164676692 FALSE FALSE FALSE TRUE Uruburuella 0.0189942708856287 -0.023338250983449 0.234431575248009 0.351627409256539 0.0810226645686884 -0.0663721040199742 0.9371970962769 0.948532597086719 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Streptococcus 0.262544109930814 -0.469846289232956 0.161305976443084 0.277567660241202 1.62761551506092 -1.69272705914179 0.138048600321531 0.124757510677347 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Lachnospiraceae_[G-14] -0.557414771582631 0.799026566646232 0.041615553453958 0.279615231334043 -13.3943856399588 2.8575931390936 0.00552766599544781 0.103750780510781 0.309549295745077 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Nitrincola 0.251426587682386 -0.449464165110837 0.272085969227807 0.423727499064809 0.924070389943102 -1.06073872029271 0.379558451556719 0.316443578637248 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Atopostipes NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Austwickia 0.013883258577809 -0.0139680617524464 0.196233850513576 0.301225160113941 0.070748540791888 -0.0463708335225477 0.945145035110534 0.96402731937263 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Mesonia -0.154397426715838 0.294546527952573 0.229300327995298 0.389503921068092 -0.67334149962055 0.756209403861384 0.517645806785323 0.468854295479349 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnoclostridium 0.186239279168725 -0.245567830286923 0.188343300968617 0.477781263469302 0.988828794074057 -0.513975429893979 0.360931097037364 0.625643077769211 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Eubacteriales_[G-1] -0.552346893697808 0.866230685941438 0.483933855141446 0.59822104872952 -1.14136857305915 1.4480110450495 0.305415188984622 0.207275686679221 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Cutibacterium -0.129276635150466 0.198514040411717 0.196951978637837 0.356564642090407 -0.65638657729956 0.556740677504933 0.535922059794477 0.597841663347318 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Epilithonimonas -0.106408721112874 0.206567234347139 0.166751860759964 0.331106144239586 -0.638126139210206 0.623870133311899 0.539286903615054 0.548197267156339 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Rodentibacter -0.0288201232792453 -0.132209250538529 0.240000216206787 0.43516394251269 -0.120083738818025 -0.303814810057874 0.907790757186603 0.770100850233058 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Eubacteriales_[G-4] -0.496314560164443 0.704126498839219 0.206240102021905 0.42422520411293 -2.40648911292591 1.65979411881378 0.0528258444842904 0.148025009149666 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Mollicutes_[G-1] -0.308214030885249 0.403165651992509 0.384767553060941 0.63548539736234 -0.80103955864603 0.634421583353288 0.453652504356065 0.549215196103859 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Oceanotoga -0.275205495031343 0.516027986531 0.332623325282944 0.454651286053226 -0.827378821966983 1.13499730971967 0.429413552876778 0.285698974328738 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Prevotella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Erysipelatoclostridium -1.75182317413233 2.44218015176794 0.0457731556416093 0.509531884270971 -38.2718462290125 4.79298789174334 2.29474928550368e-07 0.00491394638434129 1.44569204986732e-05 0.299750729444818 TRUE FALSE FALSE FALSE Acutalibacter 0.0965195712206916 -0.243462005987049 0.210043993761842 0.343453159689167 0.459520738927341 -0.708865238588539 0.66972532162329 0.517536744249638 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Pasteurella 0.0131622763699692 -0.0126462610380731 0.18357967066013 0.383076500836265 0.0716978972815415 -0.033012364398406 0.944410341067922 0.974385269803462 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Faecalibacterium -0.183569534343999 0.197962677085774 0.452965123632893 0.53649507462562 -0.405261961167617 0.368992534039418 0.702042845275209 0.727243110871983 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Turicibacter -1.11136925102899 2.04899487252668 0.900056274438005 0.953889575127245 -1.23477751624244 2.14804200187779 0.248178192539878 0.0602282117772255 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Porphyromonas -0.026358408603339 0.0598083280796586 0.176268791920989 0.299044723915288 -0.149535310908319 0.199997937755293 0.884428567983122 0.845928204664604 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Dubosiella -1.32953665346072 2.44896844365153 0.855080632889982 0.927829383454939 -1.55486699420052 2.6394598913567 0.15439947079004 0.0269376193155759 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Akkermansia -0.432989527712582 0.622182673294633 0.518949893975392 0.692330596755022 -0.834357098323474 0.898678573806827 0.428289304434258 0.395066760201097 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Romboutsia -0.891402834779645 1.52999356558691 0.573399520000604 0.640351240614375 -1.55459292114285 2.38930366421869 0.158650742056537 0.0439035202016355 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Idiomarina 0.142230847160886 -0.249271974154753 0.174215475608072 0.292455955848107 0.81640765072363 -0.852340221391208 0.435342764853349 0.416129773930511 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Corynebacterium 0.044264898394788 -0.0696677347502403 0.189572847618721 0.345044617271348 0.233498092953776 -0.201909351031703 0.820599030384779 0.844477650761399 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Acinetobacter NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lawsonibacter -0.82175783048307 1.0733226502211 0.041615553453958 0.316963743881882 -19.7464111919654 3.38626316396956 3.87980104168131e-05 0.0276251329848143 0.00232788062500879 1 TRUE FALSE FALSE TRUE Lachnospiraceae_[G-3] -0.868892945234333 1.8643884434327 0.041615553453958 0.285003907169603 -20.8790433652564 6.54162415507948 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnospiraceae_[G-11] -0.848952344130483 1.44537763406859 0.041615553453958 0.285003907169603 -20.399881142269 5.07143094430793 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Rhodanobacter -0.0860204106609949 0.12109669112067 0.237083267289154 0.363831846883132 -0.36282784375534 0.332836974437722 0.726132648549278 0.747811797095375 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Pseudomonas 0.178501906235545 -0.31576891579163 0.197395865096869 0.299363417658342 0.904283917740364 -1.05480127886571 0.389408788712909 0.31900836514833 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Clostridium -0.749201946492505 1.14920337126117 0.517569090964329 0.634765461939506 -1.44753997016437 1.81043777610366 0.185771194096231 0.107818396774849 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Catenococcus_Vibrio 0.058755973979899 -0.0962347066562777 0.25734508907213 0.358768204383433 0.228315893618745 -0.26823644202714 0.82450373395905 0.794564110212056 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Carnobacterium_Enterococcus_Vagococcus 0.0325894059271236 -1.15623476217608 0.182432142455228 0.309261518679583 0.178638509028756 -3.73869586850868 0.866904448355585 0.0201438930950854 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Enterobacter_Klebsiella_Salmonella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Malaciobacter -0.0764943878211977 0.151724289979066 0.202858810797797 0.362823606660618 -0.377081909927219 0.418176455979579 0.714850341671758 0.685619451565356 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lactobacillus -1.14678895211648 2.11393099118708 0.451566774700201 0.590861646095292 -2.53957779085462 3.5777089360208 0.0317327568580819 0.00595203621794416 1 0.352707164676692 FALSE FALSE TRUE TRUE Lacticaseibacillus -0.414796041238047 0.925872557030528 1.19974064434196 1.31270229040713 -0.345738091973667 0.705318002258817 0.741339416379034 0.507056828597942 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Staphylococcus -1.4500653539709 2.66993772792019 0.227028932912057 0.828036741638077 -6.38713901074718 3.22441939307952 0.000127182010451359 0.0104153585674267 0.0075037386166302 0.593675438343323 TRUE FALSE FALSE TRUE Vibrio 0.147923899951774 -0.259709237604715 0.694147593134266 0.906550485030373 0.213101509556285 -0.286480722136521 0.835996629973354 0.780995364281433 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Salinivibrio 0.0385297107572348 -0.0591532240813918 0.226841311764986 0.351514732477303 0.169853147371818 -0.168280924285901 0.868882308513577 0.870083270685979 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Halomonas 0.0247889792263852 -0.0339618829415024 0.258224129645091 0.356519951145977 0.095997919561025 -0.0952594176913165 0.92562582113452 0.926196047223052 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Ligilactobacillus 0.260328068396551 -0.698120401543509 0.349322419299736 0.533677315663358 0.74523721929561 -1.30813205106113 0.480396976038646 0.232144342251544 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Aliarcobacter -0.255884477837828 0.524455264888919 0.248162927741496 0.397730008701712 -1.03111484123195 1.31862130946787 0.342246969641537 0.235390454412585 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Paracoccus 0.00375772717371331 0.00459541248839592 0.189494584345136 0.365856785272683 0.0198302615702683 0.0125606867861446 0.984611453136941 0.990252314890885 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Pseudoalteromonas 0.3303652959426 -0.594185130254564 0.514552161091419 0.775025076532033 0.642044326938325 -0.766665683790949 0.536852921116282 0.462915331627438 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Enterococcus -2.04584001088527 3.76219126559653 0.189084389374115 0.308138696981589 -10.8197192674507 12.2094086281585 1.85039900475288e-06 6.64392382181866e-07 0.000114724738294678 4.18567200774575e-05 TRUE TRUE TRUE TRUE Adlercreutzia -0.934647900905112 1.43817775138207 0.0842568834803254 0.375726811892096 -11.0928373124952 3.82772191353515 3.19698358077752e-05 0.00868217735254811 0.00195015998427429 0.503566286447791 TRUE FALSE TRUE TRUE Limosilactobacillus NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Muribacter NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Aeromonas 0.137454909294527 -0.240516088066428 0.309117096623402 0.405263915142143 0.444669385148853 -0.59348014733083 0.66705975264109 0.567473582369437 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Bifidobacterium -2.05133281109074 3.77226139930657 0.420103903772214 0.625249792409228 -4.88291775599164 6.03320696000745 0.000867875235870638 0.000194432332756358 0.050336763680497 0.0120548046308942 FALSE TRUE TRUE TRUE Aliarcobacter_Arcobacter 0.00854097232380593 -0.099048284208537 0.181723173757616 0.326709827218623 0.0469999073161574 -0.303168977351444 0.964038635650529 0.771997908623155 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lactococcus -0.295680190021222 0.0496488136570952 0.411075882147659 0.48541694982879 -0.719283720748699 0.102280758170078 0.511747826344316 0.923456160287736 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Escherichia_Pseudescherichia_Shigella 0.414279760240738 -0.748028314801151 1.01817674088627 1.36177370015608 0.406883936358758 -0.549304421663758 0.693599631080858 0.596160516094072 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lactiplantibacillus -0.696004330459836 0.891101876947075 0.902304083259114 0.946948537106322 -0.771363383335111 0.941024609077593 0.496678201827511 0.416114178069833 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Bacillus 0.534572093861342 -0.968564259772256 0.117760919239242 0.31178000779817 4.53946943786427 -3.10656307507457 0.00140698211770808 0.0125884521868662 0.0801979807093605 0.704953322464505 FALSE FALSE TRUE TRUE Buttiauxella_Enterobacter_Erwinia_Klebsiella_Kluyv ...(10 species) 0.234626505127887 -0.418664013760922 0.285827357018723 0.408519696754169 0.820867909828935 -1.02483189204181 0.432925616466394 0.332197936421576 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE