taxon lfc_(Intercept) lfc_GroupM3wk se_(Intercept) se_GroupM3wk W_(Intercept) W_GroupM3wk p_(Intercept) p_GroupM3wk q_(Intercept) q_GroupM3wk diff_(Intercept) diff_GroupM3wk passed_ss_(Intercept) passed_ss_GroupM3wk Roseburia -0.0300002729093092 -0.113831061517442 0.367339590774249 0.461204932858984 -0.0816690432035302 -0.246812324429857 0.942347319154697 0.828075938376739 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Subdoligranulum -0.30365294550929 1.49445706948668 1.99842081252129e-05 0.240108668754524 -15194.6448719271 6.22408627409676 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Faecalibaculum -1.49130037540729 3.56084917388717 0.241768477249017 0.572467148329643 -6.1682994920437 6.22018081609938 4.81127358921813e-05 4.44929488294415e-05 0.00274242594585433 0.00266957692976649 TRUE TRUE TRUE TRUE Uruburuella 0.86216975102558 -0.100104356119525 0.224379607698427 0.361264169010262 3.8424603727107 -0.277094615814726 0.00234198370111901 0.786422935821773 0.100705299148118 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnospiraceae_[G-14] -0.172728396431968 0.496149678446914 0.284631970771137 0.389927093337615 -0.606848190538839 1.27241652843376 0.605665351755826 0.331144379395708 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Eubacteriales_[G-4] 0.230267273905934 0.695388873611695 0.483239581249 0.702296576605535 0.4765074775348 0.990164122645696 0.64822788914642 0.35507793486322 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Nitrincola 0.759692254658212 -0.0451805655315433 0.185697132250189 0.361282424019006 4.0910284690594 -0.125056085012224 0.00178640463043437 0.90273534409106 0.0821746129999812 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Atopostipes -0.375928755313318 1.71113287973435 0.386317954334714 0.532197929044936 -0.973107128713995 3.21521897464932 0.375192444403115 0.0235910200893857 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Austwickia 0.823801484115038 -0.1702049887444 0.203119414927153 0.370673935191545 4.0557495914927 -0.459177116557835 0.00189688384866536 0.655047834269383 0.0853597731899413 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Mesonia 0.735309870695346 0.0972332355052846 0.189752160728132 0.321471150541805 3.87510670694741 0.302463332530488 0.00220736016818631 0.767477485217208 0.0971238474001976 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnoclostridium -0.22350632154633 1.04518025117841 0.182151734705304 0.348503845655048 -1.22703372497623 2.9990494056497 0.307321141166974 0.0577125805660891 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Cutibacterium -2.58010111124061 5.13646800839961 0.256894459210526 0.95980873721901 -10.0434284148036 5.3515537098383 1.52763336882e-06 0.000322888476682411 9.16580021292003e-05 0.0184046431708975 TRUE TRUE FALSE TRUE Epilithonimonas 0.540355986983895 0.163215601487056 0.165431605369523 0.305899888992812 3.26634070785269 0.533558877789887 0.00973951052122551 0.606570586929174 0.360361889285344 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Rodentibacter 0.0776909895274398 1.16764608354255 0.566193948518973 0.70013910631949 0.137216213155688 1.66773441592294 0.894250445425975 0.133924830315225 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Mollicutes_[G-1] -0.724627440732835 2.1558213849816 0.258707660778276 0.436908318947135 -2.8009508437165 4.93426490522476 0.0187639159350131 0.000592185383761411 0.675500973660472 0.033162381490639 FALSE TRUE FALSE FALSE Oceanotoga 0.683668857693772 0.177563700174401 0.291117645360231 0.40070823443103 2.3484280963038 0.443124660082232 0.0368176710329546 0.665558571959933 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Erysipelatoclostridium -0.0897163932851672 1.09429395944988 0.323510083176396 0.445269491935998 -0.277321783618871 2.45759922758681 0.790840189419416 0.0492797559560246 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Acutalibacter -0.20240434883042 1.17188190108233 0.181061356475627 0.388189536262461 -1.11787712613136 3.01883948847606 0.314433617985896 0.0294555044298203 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Pasteurella 1.02227334617714 -0.34915439302195 0.172548409062363 0.367658191813858 5.92455967419363 -0.949671191329593 6.98245159815191e-05 0.361014319227026 0.00391017289496507 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Faecalibacterium 0.454418635026527 -0.130900183089559 0.131517836615949 0.297400072385024 3.45518635889286 -0.440148457395435 0.0745214157892755 0.702828243601796 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Turicibacter -0.410308229413683 1.87930583567489 0.480793686702356 0.826508322882569 -0.853397706255015 2.27378936623473 0.410150419177268 0.0421485669125463 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Porphyromonas 0.634801420688434 0.253579713293814 0.110091446652103 0.308046477379573 5.7661284322519 0.823186538118905 8.93451148050295e-05 0.426458904682577 0.00482463619947159 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Dubosiella 0.0723874595590651 1.12844587505061 0.568804974985807 0.670872312156088 0.127262353077821 1.68205760560299 0.900840433959685 0.118374715770304 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Akkermansia -1.03952703537288 2.85809064494474 0.411021061418456 0.647000930558013 -2.52913325605606 4.41744441152465 0.0264615130368714 0.000839336388867712 0.899691443253627 0.0453241649988565 FALSE TRUE FALSE TRUE Romboutsia -0.889481705857029 2.19823660811436 1.99842081252637e-05 0.38910440975052 -44509.2295016965 5.64947750020049 1.08655941167497e-22 0.00241272174649966 6.84532429355233e-21 0.125461530817983 TRUE FALSE FALSE TRUE Idiomarina 0.570897017554242 -0.4579508833756 0.120022334994789 0.27001642960442 4.7565898262105 -1.69601117993638 0.00892753799027357 0.165125093352968 0.348173981620669 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Eubacteriales_[G-2] 0.167331712932835 0.983555569489217 1.99842081252637e-05 0.340289467487456 8373.19707060584 2.89034972710542 1.22063539114555e-15 0.0445472616994809 7.56793942510239e-14 1 TRUE FALSE FALSE FALSE Corynebacterium 0.888999845034091 -0.141840057910541 0.213477264775011 0.382551170315223 4.16437715731007 -0.370774079173944 0.00131251898342517 0.717268323483855 0.061688392220983 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Acinetobacter 1.96983664618071 -3.75178266531581 1.99842081252129e-05 0.240108668754524 98569.6622972756 -15.6253528236894 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lawsonibacter 0.127234503801559 0.906126954306037 0.355219715708147 0.554058560660631 0.358185365775408 1.63543534680814 0.732469203901368 0.153074573153673 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnospiraceae_[G-3] -0.777048005162973 2.46967827109407 0.247983840803704 0.370019092399198 -3.13346225562357 6.67446172866573 0.0350679650041893 0.00261900538180939 1 0.133569274472279 FALSE FALSE FALSE FALSE Lachnospiraceae_[G-11] -0.458798782142297 1.30594466289299 0.477788726964211 0.562672816080319 -0.960254514704496 2.320966333491 0.512906127811113 0.258989294551055 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Rhodanobacter 0.409603537337775 0.272639239293719 0.216957355403697 0.358321328680793 1.88794492159815 0.760879181536516 0.095728214775164 0.468560507792035 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Mammaliicoccus -1.72527690356118 3.92481266212654 0.495070701304522 0.61559970516454 -3.48491013306793 6.37559217328979 0.0045054079797581 3.52771798852409e-05 0.184721727170082 0.0021519079729997 FALSE TRUE TRUE TRUE Clostridium -0.509480685934608 2.27768531356687 0.587148419703228 0.695955730423108 -0.86772044143817 3.27274453532 0.408087881432805 0.00964035052491087 1 0.482017526245544 FALSE FALSE TRUE FALSE Catenococcus_Vibrio 0.133548666775272 0.302839627206848 0.130873589619781 0.287568219592672 1.02044016033535 1.05310533839869 0.346888596836389 0.332843443427568 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Staphylococcus -1.12915212214655 3.45641116410684 0.287504350616149 0.681218078068158 -3.92742621016575 5.07386881732315 0.00347158470798394 0.000668359276692381 0.145806557735325 0.036759760218081 FALSE TRUE FALSE FALSE Carnobacterium_Enterococcus_Vagococcus NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Mannheimia_Muribacter NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Malaciobacter 0.821785916305598 -0.0372850576662189 0.185917042654629 0.344785626080395 4.42017528125272 -0.108139826158313 0.000835331917144348 0.915671891165441 0.040931263940073 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Lactobacillus -1.90439475691755 4.20344043401423 0.358846151793725 0.647493964563568 -5.30699506570786 6.491860409614 0.000186203911929125 2.97176838037143e-05 0.00968260342031449 0.00184249639583029 TRUE TRUE TRUE TRUE Lacticaseibacillus 0.114725299865325 0.541252292407352 0.783204231217256 0.85175150125215 0.146481971486567 0.635457984648883 0.890626874041597 0.55966554272624 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Vibrio 1.10700162788607 -0.480953942346953 0.625289277315185 0.852251621853801 1.77038319390222 -0.564333267328717 0.102039902869119 0.582921897397266 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Salinivibrio 1.03927954344267 -0.375608477657227 0.151049022935053 0.31182381411804 6.88041222146491 -1.20455353520575 1.69742680864372e-05 0.251595759648868 0.000999691246662819 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Halomonas 0.871095758158798 -0.113989256104528 0.148913625941171 0.316891707581589 5.84967126180197 -0.359710441697752 7.84196880037613e-05 0.725314506523065 0.00431308284020687 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Ligilactobacillus -2.24827318172768 4.82191634325002 0.311119540677428 1.15357446665009 -7.22639657037393 4.17997839121089 1.6943919434963e-05 0.00153660883171252 0.000999691246662819 0.0814402680807634 TRUE FALSE FALSE FALSE Aliarcobacter 0.387860859205816 0.518775217329629 0.144550314191638 0.292458089986806 2.68322390978416 1.77384464677668 0.0250732902885225 0.109838279937355 0.877565160098287 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Paracoccus 0.998425884302031 -0.312058341216225 0.184082326014206 0.364286367466343 5.42380089343819 -0.856629204618966 0.000154039642309183 0.408431055902661 0.00816410104238667 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Pseudoalteromonas 0.966590002508106 -0.262535858425676 0.469663690434103 0.656793676938524 2.05804711370109 -0.399723486452274 0.0619844220410679 0.696383574291287 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Enterococcus -0.907460828019101 2.65265432239443 0.216418943074571 0.436791425222518 -4.19307485346335 6.07304578161776 0.00124716093809413 5.55962855594326e-05 0.0598637250285184 0.00328018084800652 FALSE TRUE TRUE TRUE Adlercreutzia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Muribacter NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Aeromonas 0.473258096666049 -0.031583420244552 0.173995198261223 0.301373571054417 2.71994917903157 -0.104798241378801 0.0297677862160789 0.919475554032943 0.982336945130605 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Bifidobacterium -2.11152953852888 4.52565009429852 0.453888644922513 0.831845305597792 -4.65208716311763 5.44049484182187 0.000558438153847209 0.00014994437127811 0.0279219076923604 0.00869677353413036 TRUE TRUE TRUE TRUE Sporosarcina 0.445764982584432 -0.206152508693734 0.365478645883505 0.468681560140716 1.21967449426996 -0.439856239771497 0.276976920923623 0.678403584303231 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Aliarcobacter_Arcobacter 0.0240826355961604 0.0443853245114577 0.0987048083296794 0.255211774880546 0.243986448114292 0.173915660953468 0.819244689155334 0.870378713197604 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus -2.77589782685945 5.55911187614609 0.163197788043583 0.774728439802156 -17.0094084003034 7.17556190084583 9.15752448589603e-10 1.12389284797395e-05 5.58608993639658e-08 0.000708052494223587 TRUE TRUE TRUE TRUE Lactococcus 0.267116102453971 0.0470227287495931 0.453548275136203 0.541921136168908 0.588947455204751 0.0867704276714847 0.58754928424193 0.935024056630727 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Escherichia_Pseudescherichia_Shigella 0.391103697222416 0.479612304188422 0.96590131333131 1.177411009914 0.404910617497281 0.407344844026432 0.694069103978192 0.692337753308969 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lactiplantibacillus -0.219377388656353 0.96742486787474 0.863687286320313 0.928799720886858 -0.254000947022153 1.04158608806536 0.809609420646834 0.345324285113257 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Bacillus 0.576197208366756 -0.366198739288035 0.135876153682694 0.279183148295869 4.24060582191873 -1.31167923824668 0.00543613457614498 0.237580188291077 0.217445383045799 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Pseudomonas 1.52952203566934 -1.31700088502015 0.48437090818215 0.581390117552801 3.15774958783066 -2.26526190462902 0.009115417565987 0.0446776159699852 0.348173981620669 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Buttiauxella_Enterobacter_Erwinia_Klebsiella_Kluyv ...(10 species) 0.68721377790653 0.0517500338444269 0.136973977521406 0.331700926397689 5.0171119386464 0.156014137212212 0.000391820842050461 0.878848210168709 0.0199828629445735 1 TRUE FALSE FALSE TRUE