taxon lfc_(Intercept) lfc_GroupMale Healthy Baseline se_(Intercept) se_GroupMale Healthy Baseline W_(Intercept) W_GroupMale Healthy Baseline p_(Intercept) p_GroupMale Healthy Baseline q_(Intercept) q_GroupMale Healthy Baseline diff_(Intercept) diff_GroupMale Healthy Baseline passed_ss_(Intercept) passed_ss_GroupMale Healthy Baseline Lachnospiraceae_[G-3] -0.292481361387514 1.82419317027586 0.292949434319162 0.481352376065178 -0.998402205716026 3.78972507664291 0.330011484591816 0.00114975876986908 1 0.0880195776975108 FALSE FALSE TRUE FALSE Fretibacterium 1.0862114749234 -3.15843891078433 0.364290499675753 0.599171873095819 2.98171782105273 -5.27134041600654 0.00880898429278223 7.60370366886672e-05 0.669482806251449 0.00608296293509337 FALSE TRUE FALSE FALSE Ruminococcaceae_[G-2] -0.154567770085717 0.672040901856474 0.110887657056391 0.460440005133951 -1.39391321080138 1.45956236287715 0.205993627957922 0.187781337611727 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Prevotella -0.0620270058146787 0.977937611787383 0.359562344778389 0.563532107552125 -0.172506956625027 1.73537159406117 0.864197539953671 0.092938330717874 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Dialister -0.23420538844958 1.23955652765755 0.270888486148606 0.484666027676251 -0.864582292807742 2.5575477893523 0.397036946354873 0.0183398771391298 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Haemophilus 0.0204273259219424 0.88577479303132 0.569282833288276 0.781502762577588 0.03588256087743 1.13342503116664 0.971630598711626 0.266647672843157 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnoanaerobaculum 0.168444724333653 0.200880436306164 0.343560082646189 0.539315054187413 0.490291896067342 0.372473259825523 0.628202915619936 0.712679585059505 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Actinomyces 0.117115469479294 0.50022434433679 0.256419841316269 0.429529667265786 0.456733257762388 1.16458624970196 0.651152687318672 0.253364165374681 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Granulicatella 0.363008371062686 0.00760698968428743 0.396030716933497 0.579224150156822 0.916616705576512 0.0131330671938107 0.366903670400831 0.989611564777254 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-5] 0.825627764721146 -4.04918227245186 0.373618449522312 0.458541913834896 2.20981529626481 -8.83056085012509 0.0580977488855014 2.13055470556177e-05 1 0.00172574931150504 FALSE TRUE TRUE FALSE Slackia 0.197829988711048 -0.0988049093776703 0.211065211596033 0.338232453328888 0.937293205332595 -0.292121315992097 0.370692327383358 0.776164573778307 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Veillonellaceae_[G-1] 0.049197344376296 0.348940529288715 0.19214513732311 0.458270616295368 0.256042619978283 0.761428982965412 0.801396035882083 0.458205647150785 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptococcus 0.490736098979495 -0.539329232340912 0.26299361801088 0.457100617852133 1.86596200581261 -1.17989171590964 0.0817233469045952 0.256417812713666 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Capnocytophaga 0.0673682268894058 0.707765725999638 0.342162707961322 0.523368038812818 0.196889448563229 1.35232890339482 0.845336257616658 0.187092058852658 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Bacteroidales_[G-2] 0.233003835899028 -0.342352886135134 0.288064140014985 0.511391250853545 0.808860956753963 -0.66945393681203 0.431238360959627 0.513379446475208 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Riemerella -0.139152271446687 1.39711970227442 0.373433665204637 0.560491755758465 -0.372629155891538 2.49266771173793 0.712695014416108 0.0199774129438622 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Rothia -0.29029066456669 1.58664070179274 0.47486772595167 0.768138869781704 -0.611308473291011 2.06556491828574 0.545600109954704 0.0476018153767157 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Solobacterium -0.0302586047148409 0.632146024127801 0.18333438187459 0.418141380229709 -0.165045990858056 1.51179972616087 0.870975035901362 0.150083418030676 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Abiotrophia 0.00400136502215794 0.662748515441947 0.394366613021052 0.619272947050896 0.0101463077503073 1.07020421059581 0.992005085153536 0.2972736419586 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Treponema 0.576165217211864 -0.832722833218085 0.47220020704521 0.78292363809803 1.22017146247608 -1.06360670785344 0.232577298465192 0.296594071230708 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcus 0.129286450338571 0.0358143162271782 0.14623951331803 0.519425996860298 0.88407330826799 0.0689497954350765 0.392713729672651 0.946078869223803 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Erysipelotrichaceae_[G-1] -1.01026637226537 3.55210982607352 0.0975699613726723 0.286154615819975 -10.3542766447003 12.4132536387539 0.00919889284640584 0.00642726171268129 0.689916963480438 0.443481058175009 FALSE FALSE FALSE FALSE Parvimonas 0.334120461986792 -0.007004062828894 0.475731597104317 0.674313007494027 0.702329767500239 -0.0103869608787816 0.488961769313222 0.991794998837588 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Oribacterium 0.383796024701169 -0.131968389252755 0.279328400137885 0.692849646824989 1.3739957144054 -0.190471900877059 0.185436671201489 0.850959741960995 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] -0.420437080851392 1.60914750135092 0.142998262298229 0.300385671767683 -2.94015517457514 5.35693827166106 0.0605026250181544 0.0127278469476639 1 0.840037898545816 FALSE FALSE TRUE FALSE Megasphaera 0.949061051562367 -0.953432163372583 0.2341628805204 0.455905419393242 4.05299528880576 -2.0912937701892 0.00366892413330375 0.0698773479222717 0.289845006530996 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-7] 0.182795502190409 0.0637776658421985 0.260929637842236 0.497504705237205 0.700554769101895 0.12819510081174 0.494305031440213 0.899697525888564 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Streptococcus 0.111694186612603 0.514681098647962 0.301418073885906 0.447400687358023 0.370562339453082 1.15038066143179 0.713567235132392 0.259074706052139 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Gemella 0.151740392074556 0.418397202337373 0.351777378200566 0.500111762610983 0.43135346806764 0.836607401819556 0.669401161133518 0.409654443858756 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Campylobacter 0.308448118956043 0.170650958935119 0.236565982092381 0.423683855205228 1.30385660790228 0.402778998629669 0.20370909160541 0.6904035655568 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] 0.165027167336204 0.570938116513077 0.316993187853491 0.49805580186056 0.520601620664723 1.14633363245696 0.607224834685486 0.262511203537143 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Anaeroglobus 0.584761553258788 -1.40304006458048 0.243938529775184 0.386836759309069 2.39716765448127 -3.6269564120185 0.0433679935076063 0.00671456782201583 1 0.456590611897076 FALSE FALSE FALSE FALSE Butyrivibrio 0.239956836985232 0.063775972369061 0.123789323701205 0.293920971053006 1.93842917798327 0.216983402513186 0.192146379907004 0.848344237538142 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Stomatobaculum -0.154247160936752 1.11197234273791 0.296349457617315 0.478044805755129 -0.520490781987313 2.32608393470862 0.609849304955879 0.0334807744298021 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Pseudoleptotrichia 0.228671602223007 0.126561224258479 0.317121560381526 0.568849797530786 0.72108500585042 0.22248619021725 0.477546905574322 0.8257430795573 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Olsenella 0.475307917076338 -0.263651225734441 0.336055703757223 0.610373729475745 1.4143724143415 -0.431950480504613 0.175306631584179 0.671206192019895 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Mogibacterium 0.291713515327823 -0.0370618454261052 0.284167919386015 0.650429879541283 1.02655329974654 -0.0569805394737448 0.31752346949832 0.955155670308578 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Filifactor 0.423979967191308 -2.2955765279585 0.287645608566115 0.386791031905091 1.47396641758171 -5.93492697245829 0.174586893718342 0.00021938312944246 1 0.0173312672259543 FALSE TRUE TRUE FALSE Lautropia 0.467853350004836 -0.0395760638959048 0.316952856464981 0.550938288027971 1.47609759767704 -0.0718339326852077 0.152918698995831 0.94332934781472 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Johnsonella 0.0858768423420732 0.277168804573938 0.32765510378032 0.457633947851262 0.26209523780118 0.605656127294173 0.798567835101286 0.55823811461827 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Neisseria -0.12700788556286 1.27348231930028 0.505249505827081 0.695428824212915 -0.251376565633551 1.83121877460516 0.803295758492632 0.0773601192580831 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-3] -0.305062282819315 0.877934931793161 0.281387587203112 0.50999808718582 -1.08413553650863 1.72144749922029 0.303750441193741 0.11590180636376 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Cardiobacterium -0.154090124448453 1.49359153920437 0.313862260475101 0.463949642887583 -0.490948240209583 3.21929666743224 0.627922360859388 0.00366525500241215 1 0.267563615176087 FALSE FALSE TRUE FALSE Ruminococcaceae_[G-1] -0.459989978621761 1.44581103608227 0.199406252096325 0.435305121824637 -2.30679817601485 3.32137382170457 0.0381741083635798 0.00551618121035867 1 0.386132684725107 FALSE FALSE FALSE FALSE Weeksellaceae_[G-1] -0.0485889158862474 0.864767937751051 0.207947082913942 0.529048460709251 -0.233660002368756 1.63457225939516 0.817885721472196 0.119506034477407 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Shuttleworthia -1.55901584546973 2.79041236773274 0.0994293118072577 0.296654307479897 -15.6796403106145 9.40627625277896 0.000563818572041837 0.00254579459305906 0.045105485763347 0.189135869151879 TRUE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-1] 0.314638540670018 -0.336247109519046 0.269032996043623 0.421228593863892 1.1695165474015 -0.798253286736024 0.266913142910116 0.441616769505736 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lancefieldella -0.630596969441272 1.72318118577136 0.270233707216683 0.533759105093131 -2.33352447382012 3.22838743045085 0.032992747143049 0.00525456905282804 1 0.373074402750791 FALSE FALSE FALSE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-4] 0.236677293771028 0.0302344420883963 0.12221747783893 0.403249245245792 1.93652575683932 0.0749770580970772 0.124874933647406 0.943832966885989 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Ottowia 0.155186600713102 0.380016259298909 0.259400470213865 0.50351922485852 0.59825103857814 0.754720456613522 0.559951643067615 0.463870450678328 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptoanaerobacter -0.328832997652824 1.39078613981036 0.210470674113052 0.438349644599951 -1.56236966997214 3.172778070984 0.152636543382674 0.011315338091325 1 0.758127652118773 FALSE FALSE TRUE FALSE Centipeda -0.0232423968377633 1.28793543540026 0.13283474061225 0.295936169325307 -0.174972275555601 4.35207172660435 0.872244085437743 0.0224095821070299 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Leptotrichia -0.0690471282182293 1.20293871451005 0.297756890045166 0.482078886211845 -0.231890950391629 2.49531507999176 0.818510384555366 0.0195475776225083 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Kingella 0.0845050410411564 0.727680745360566 0.30646926382287 0.588632220462053 0.275737409967473 1.23622309493926 0.784929507911148 0.227427727442357 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Arachnia -0.0617326480552571 0.869445444436385 0.405833230542479 0.729743771856803 -0.152113339690638 1.19143934894315 0.880228522297416 0.243849465264679 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-9] 0.214153657382796 -0.00273822300071234 0.251910530756187 0.40958314969557 0.850117923772176 -0.00668538977432928 0.405845209319059 0.994735566824059 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Porphyromonas 0.126388947374459 0.489842182855827 0.313502581474776 0.603124828022229 0.403151217383606 0.812173799016234 0.689793955820984 0.423308963658001 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Tannerella 0.455766786032095 -0.222128060057806 0.395779095709715 0.569231522075698 1.15156861737432 -0.390224454274455 0.260841628925214 0.699812510456569 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Aggregatibacter -0.119659169535657 0.895009260834056 0.358946382691442 0.683397875068472 -0.333362238221852 1.30964595221251 0.741435890230119 0.201350602852315 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Catonella 0.233853092782687 0.563117137482974 0.252955865305686 0.452184455467212 0.924481796459177 1.24532617314574 0.36526540991256 0.226113197132096 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-8] 0.0539865535987437 1.66663636098264 0.11383658454301 0.290466647172337 0.474246076649871 5.73778909629442 0.68205823044676 0.0290572218918264 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Cryptobacterium -0.0347692236228421 0.69559540345356 0.104950084328376 0.389377494227121 -0.331292955554505 1.78642940017438 0.750120254603511 0.117188117262577 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Peptidiphaga 0.16401379769678 0.5074408701241 0.398658377902027 0.682834650977429 0.411414400871031 0.743138722379912 0.684419559667907 0.464610580241472 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Gracilibacteria_(GN02)_[G-1] -0.614564805231704 2.01662145291132 0.12022536891796 0.360553212246432 -5.11177308718488 5.59313128940588 0.00373290786566248 0.00252181158869172 0.291166813521674 0.189135869151879 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-6] 0.169157954280146 -1.61615659759256 0.231488095645778 0.344918678575768 0.730741482875177 -4.68561634373055 0.483525295392129 0.00114311139866897 1 0.0880195776975108 FALSE FALSE TRUE FALSE Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] 0.254985346565118 -0.114718226560957 0.114176162872646 0.352670998228518 2.23326253177323 -0.325283981776759 0.0524168215414009 0.75240072339066 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Scardovia -1.54336459110003 3.14164529022878 0.161628297614156 0.533364544170159 -9.54885136997729 5.890240220442 1.19681891455867e-05 0.00036574884603752 0.000969423320792523 0.0285284099909266 TRUE TRUE FALSE TRUE Cutibacterium -0.818507787367901 -0.298556223032901 0.212818350664579 0.336215066704006 -3.84603952061419 -0.887991802270245 0.00849900944250019 0.408728915712252 0.654423727072515 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Lachnospiraceae_[G-7] -0.367637911510633 1.18650836870337 0.186297247430499 0.353664890524116 -1.97339422123124 3.3548944226412 0.11970329633598 0.0284392706729321 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-4] 0.18850479572178 -0.633307337693853 0.279417570893281 0.378602335037069 0.674634723647269 -1.67275074421251 0.513837050294587 0.122545414378164 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Selenomonas -0.0165714052233895 0.869736751586851 0.350069420244421 0.617377634084395 -0.0473374829821446 1.40875973402684 0.962592669059505 0.170318943236398 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Bacteroidetes_[G-5] 0.31954023204509 -0.333270474057207 0.182432627495611 0.318261550541699 1.75155199172241 -1.04715908500402 0.140241611920869 0.342983517672121 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-2] -0.190830871848919 0.199569657536294 0.153488270423761 0.316800719096713 -1.24329286740974 0.629953297155773 0.260136490055699 0.55194446577601 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Fusobacterium 0.326477099022897 -0.104776754310787 0.218688318196042 0.370367143070377 1.49288769384668 -0.282899701745079 0.146267224353349 0.779263293912568 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Alloprevotella -0.179012641262855 0.685916500593718 0.382655971139868 0.552979984755693 -0.467816144955497 1.24040023057391 0.645530370761386 0.230753263772746 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Corynebacterium 0.0309346720632612 0.779236193397261 0.304828311325564 0.597593102178637 0.101482280070181 1.30395781101959 0.919917515462332 0.203256059452573 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Schaalia 0.264558908423379 0.100454110808873 0.35437636989078 0.512689556691224 0.746547825705524 0.195935551051946 0.46134635222154 0.846027122827266 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Eikenella -0.0354724476654123 0.9564186994064 0.254419208696996 0.392968922630188 -0.139425194532613 2.43382782792332 0.890188570839727 0.0221171934536446 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Lacrimispora -0.282129956330702 1.38222041377614 0.119798535876937 0.381835008564564 -2.35503676456046 3.61994155269402 0.0998482851037283 0.036248887188066 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Propionivibrio -0.115484213998695 1.49758475521668 0.170483945507524 0.366099043250949 -0.677390552259354 4.09065465432022 0.519910531603154 0.00462714430947347 1 0.33315439028209 FALSE FALSE TRUE FALSE Veillonella 0.0905636663659115 0.504666280053093 0.427993317440752 0.646067540321992 0.211600655139781 0.781135482834463 0.833898673135159 0.441053331110919 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE