taxon lfc_(Intercept) lfc_DayD15 se_(Intercept) se_DayD15 W_(Intercept) W_DayD15 p_(Intercept) p_DayD15 q_(Intercept) q_DayD15 diff_(Intercept) diff_DayD15 passed_ss_(Intercept) passed_ss_DayD15 Streptococcus -0.0889433066781198 -0.0912364935442996 0.0988482321965286 0.240360738830373 -0.899796634716583 -0.37958151563466 0.398124580684738 0.715509311132589 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Mogibacterium 0.859475699031677 -4.68502352596266 0.332161235232881 0.40641929133005 2.58752559861205 -11.5275618699851 0.122509039172465 0.00744142766549683 1 0.267891395957886 FALSE FALSE FALSE TRUE Schaalia 1.47303326512372 -2.67513111355089 0.132715795756437 0.241118943008189 11.0991555807499 -11.0946534526739 3.18652283414056e-05 3.19397264248752e-05 0.00178445278711871 0.00213996167046664 TRUE TRUE FALSE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-7] -0.383750433497104 0.350974196684178 0.106615174881643 0.57442146243788 -3.59939787111093 0.61100467102086 0.00874683446713371 0.560505168748299 0.300275485002999 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Alloprevotella 1.72072642702744 -2.80574109410263 0.128955405865192 0.270302450555168 13.3435773047487 -10.3800061314279 3.10990466549819e-06 1.67220615943296e-05 0.000217693326584873 0.00122071049638606 TRUE TRUE TRUE TRUE Bacteroidales_[G-2] -0.0404834646807133 -0.163926256540409 0.138306698637202 0.25005663326515 -0.292707909881554 -0.655556520936554 0.778231660803963 0.533054737103582 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Ruminococcaceae_[G-1] 1.18067111228529 -3.62670788334074 0.167648093709513 0.362822532213963 7.04255614341232 -9.99581768312559 0.00588331430717551 0.00213100933946255 0.217260181685604 0.0958954202758149 FALSE FALSE TRUE TRUE Bifidobacterium 0.681887691258113 -2.57939907673682 1.03840823973882 1.07276075840826 0.656666294779807 -2.40444950704953 0.558272480142774 0.0954918007639406 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Slackia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Solobacterium -2.42201514757063 3.40837126779447 0.163899227993267 0.291346906578568 -14.7774652585315 11.6986698359721 1.55571718663264e-06 7.54028089640086e-06 0.000113567354624183 0.000573061348126465 TRUE TRUE TRUE TRUE Gemella -0.148302259238535 -0.00219806470367624 0.221531284459241 0.338219896274199 -0.669441607764526 -0.00649892193773911 0.524672030798258 0.994995981485725 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcus -2.09316735416016 2.91509957767876 0.191816000974791 0.285120984075482 -10.912370936329 10.2240793925818 1.19982519829912e-05 1.84828672105404e-05 0.000779886378894428 0.00133076643915891 TRUE TRUE TRUE TRUE Eikenella -0.0171993341648491 -0.198852452314205 0.241716976861282 0.406609151393522 -0.071154845589185 -0.489050607033073 0.945264764904138 0.639755907721522 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Ruminococcaceae_[G-2] -1.71712851472098 2.35104131852 0.199389286792453 0.283994769544523 -8.61193970019243 8.27846696715805 5.67669489045549e-05 7.32135543441763e-05 0.00312218218975052 0.00453924036933893 TRUE TRUE TRUE TRUE Veillonellaceae_[G-1] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Filifactor -0.302364667119509 0.228895547117784 0.0774586897372621 0.307952915898721 -3.9035603125372 0.743280986477372 0.00587189680231362 0.481507694184574 0.217260181685604 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Granulicatella 1.58355733040005 -2.59998744916156 0.133096827579817 0.372974089488484 11.8977841861062 -6.9709599739953 6.73389545554337e-06 0.000217094037988019 0.000457904890976949 0.011723078051353 TRUE TRUE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-8] -1.70611619445887 2.33452283812683 0.129757626221804 0.282785829679253 -13.1484849417828 8.25544490957959 3.43553761285404e-06 7.4534436565029e-05 0.000237052095286929 0.00454660063046677 TRUE TRUE TRUE TRUE Bacteroidetes_[G-3] -5.11635063657079 6.61833299460236 0.104242810524139 0.292238174228944 -49.0810887661745 22.6470515430248 4.79714252108211e-09 4.85258048745276e-07 3.78974259165486e-07 3.83353858508768e-05 TRUE TRUE TRUE TRUE Porphyromonas -0.830504882664345 1.02110587043504 0.202517573687281 0.289389583689553 -4.10090278854899 3.52848176985681 0.00456785036448029 0.00961741200843422 0.173578313850251 0.336609420295198 FALSE FALSE TRUE TRUE Kingella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Leptotrichia 2.53212687091798 -4.02284175993845 0.121443112562259 0.25943490369683 20.8503126895719 -15.5061701514128 1.46690273300555e-07 1.12061894425953e-06 1.11484607708422e-05 8.74082776522436e-05 TRUE TRUE TRUE TRUE Arachnia 1.30941752554928 -2.18877774188539 0.113868379489038 0.266438794308387 11.4993954548666 -8.21493637053475 8.45900128250203e-06 7.69245173248882e-05 0.000566753085927636 0.00461547103949329 TRUE TRUE TRUE TRUE Lachnoanaerobaculum 0.792139422040372 -1.41286058662204 0.138073611212901 0.356686407554631 5.73708049700348 -3.96107212581584 0.000707755968624094 0.00545418560711751 0.0314630138284026 0.207259053070466 TRUE FALSE TRUE TRUE Lautropia 1.36181852406874 -2.26737923966459 0.20121782668228 0.43262102612949 6.76788208342509 -5.24102875893491 0.000260719718562557 0.00119790657699607 0.0127752662095653 0.0574995156958113 TRUE FALSE TRUE TRUE Johnsonella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptococcus 1.11408624301192 -3.65989545612135 0.109343484119793 0.289488779951857 10.1888672377713 -12.6426159132316 0.00201481001100615 0.00106724409181699 0.0846220204622582 0.0522949604990323 FALSE FALSE TRUE TRUE Tannerella 0.0656037566414721 -0.323057088523687 0.0911655860215708 0.239727850761542 0.719610979366156 -1.34759931938419 0.495082462703768 0.219771198828519 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-1] 0.196939113832186 -0.520060124309759 0.392313566060817 0.464907281096503 0.501994146696566 -1.11863191964466 0.631073494084915 0.300210200757018 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Selenomonas 2.09662460147666 -6.11624135228319 0.0930490263143026 0.248311051979063 22.5324722302267 -24.6313698223907 0.000191413840273007 0.000146701335477411 0.00957069201365037 0.00806857345125763 TRUE TRUE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-3] -1.10784080586495 1.43710975523595 0.132964059490461 0.33791564560321 -8.33188163862004 4.25286539387834 7.02495840570699e-05 0.00377973087357775 0.00379347753908177 0.162528427563843 TRUE FALSE TRUE TRUE Bulleidia -0.636188120340267 0.729630726948921 0.23072474508007 0.321311104105269 -2.7573467255083 2.27079213144739 0.0282036321585132 0.057410396343795 0.817905332596882 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Shuttleworthia -0.444168144928633 0.429614027383591 0.333831424179301 0.493197952593844 -1.3305162808462 0.871078286363821 0.23168035155284 0.417197771113336 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Erysipelotrichaceae_[G-1] 0.48359641538341 -1.41571722917548 0.123193883243921 0.307771046725995 3.92549047606447 -4.59990387086632 0.0171680713466684 0.0100316197925604 0.532210211746721 0.341075072947055 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-9] 1.58763855439831 -3.77019359373825 0.390384892258095 0.459235987662845 4.06685449637912 -8.20970850504466 0.0152623729259103 0.0011996625818789 0.49638490297972 0.0574995156958113 FALSE FALSE TRUE TRUE Treponema -0.812923514024466 0.99473381747522 0.134331669376912 0.243765576361225 -6.05161476660832 4.08069848222199 0.000515134825150367 0.00468555699708334 0.0247264716072176 0.187422279883334 TRUE FALSE TRUE TRUE Fusobacterium -0.244913406456515 0.142718656123294 0.106097373307528 0.320092396275545 -2.3083833163958 0.445867061460708 0.0543160101009475 0.669157668788568 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] -0.649357358401776 0.749384584041185 0.144533683061845 0.322322156623572 -4.49277528009801 2.32495523078906 0.00282266909285063 0.0530062090853658 0.112906763714025 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Abiotrophia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Campylobacter 1.91208143107646 -4.41907934709454 0.0913306903730904 0.292826303877158 20.9358039807376 -15.0911283876614 3.07620850354218e-05 0.000112371745692053 0.00175343884701904 0.00651756125013907 TRUE TRUE TRUE TRUE Actinomyces 2.37249708417608 -3.7833970798256 0.303017937832774 0.420993106130416 7.82955986416022 -8.98683856037675 0.000104558306724621 4.30649408103844e-05 0.00554159025640491 0.00271309127105422 TRUE TRUE TRUE TRUE Lancefieldella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Phocaeicola -3.84624694563538 4.92486140668849 0.159111158518748 0.354519490690101 -24.1733325396042 13.891652041759 3.29334526290345e-07 8.66685821377554e-06 2.43707549454855e-05 0.000650014366033165 TRUE TRUE TRUE TRUE Peptoanaerobacter -1.58028492336904 2.14577593149209 0.15243274113018 0.470101218495776 -10.3670964102092 4.56449770191645 1.68603842258628e-05 0.00259101913114319 0.00107906459045522 0.114004841770301 TRUE FALSE TRUE TRUE Lacticaseibacillus NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Cardiobacterium 1.90020751978693 -3.07496273324188 0.196988316624948 0.309375162654902 9.64629553845468 -9.93926825558361 2.71130109290514e-05 2.22705350900211e-05 0.00159966764481403 0.00153666692121146 TRUE TRUE TRUE TRUE Rothia 0.644621653048565 -1.19158393313433 0.201372506414634 0.467436721764493 3.20114033700939 -2.5491876817814 0.0150419667569612 0.0381488165828328 0.49638490297972 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptidiphaga 1.92157982295176 -5.55209848829828 0.131744907418246 0.278792015793459 14.5856098775141 -19.9148403604625 0.000698869717510071 0.00027670187177289 0.0314630138284026 0.0146651992039632 TRUE TRUE TRUE TRUE Anaeroglobus 0.518265569532339 -3.4804887845266 0.152550262227873 0.277442894297849 3.39734302624913 -12.544883491556 0.0767932683239418 0.00629435461513428 1 0.232891120759968 FALSE FALSE FALSE TRUE Pseudoleptotrichia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Olsenella 2.30253060811576 -4.39155673186384 0.22027150816748 0.321484116903246 10.4531476960927 -13.6602603393483 0.000138165517993274 3.77042845666204e-05 0.00718460693565024 0.00245077849683032 TRUE TRUE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] 2.03241893839042 -3.27327986114712 0.102150158583802 0.242910157563554 19.8963855423002 -13.4752695975289 2.02613617302875e-07 2.90995323727682e-06 1.51960212977156e-05 0.000224066399270315 TRUE TRUE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-2] -1.18150713759481 1.9011976208907 0.12411307643073 0.32261663223661 -9.51960237851518 5.89305519591545 0.000679804405364465 0.00414668023082445 0.0314630138284026 0.170013889463803 TRUE FALSE FALSE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-2] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Oribacterium 1.48798768349051 -2.66183529808703 0.108253133740771 0.284488087003929 13.7454467327822 -9.356579131731 9.2192670603688e-06 8.45214590196319e-05 0.000608471625984341 0.00498676608215828 TRUE TRUE FALSE FALSE Dialister -0.259885274598672 0.165176458336528 0.127999381117667 0.341065179432766 -2.03036352464676 0.484295871572809 0.0818688493895179 0.642960706822571 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Weeksellaceae_[G-1] -0.316474961862599 0.250060989232419 0.197464037956361 0.280491302802663 -1.60269669929742 0.891510669791952 0.15303592204568 0.402258376893376 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Corynebacterium NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Fretibacterium -0.963622220444029 1.22078187710456 0.217252694571062 0.299219587087646 -4.43549030471902 4.07988624336607 0.00302412472809688 0.00469035788579783 0.117940864395778 0.187422279883334 FALSE FALSE TRUE TRUE Capnocytophaga 0.276718339998552 -0.639728963559306 0.204496962723515 0.321200142822401 1.3531660143661 -1.99168330978304 0.218073341929575 0.0866758577631865 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Catonella 1.38562219812389 -2.30308475074731 0.137547188113208 0.303220859544374 10.0737951617263 -7.59540341059642 2.03815387726458e-05 0.000126765925334223 0.00126365540390404 0.00709889181871649 TRUE TRUE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-4] -2.1540416774047 3.00641106254558 0.0848002406101176 0.333575982845835 -25.4013628016487 9.01267242592527 3.74278709160027e-08 4.22683636723878e-05 2.88194606053221e-06 0.00270517527503282 TRUE TRUE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-5] 2.15722337675801 -4.20698669774717 0.137069468979596 0.286079293458133 15.738175633256 -14.7056665545172 1.88333216602107e-05 2.62785085611847e-05 0.00118649926459328 0.00178693858216056 TRUE TRUE TRUE TRUE Lachnospiraceae_[G-3] 1.51158506150174 -2.49202904581409 0.104385884132611 0.270518479486718 14.4807420472813 -9.21204736379735 1.78589979548587e-06 3.66524316954932e-05 0.000128584785274983 0.00241906049190255 TRUE TRUE TRUE TRUE Prevotella -1.32032745314049 1.75583972614925 0.133354728246484 0.282114390806605 -9.90086718710178 6.22385735491571 2.28456350866803e-05 0.000435041864506415 0.00137073810520082 0.0221871350898271 TRUE TRUE TRUE TRUE Riemerella 1.77968198367899 -3.16576906323933 0.156693630749475 0.264393136167963 11.3577174462463 -11.9737187928668 2.79060782980383e-05 2.05668138940708e-05 0.00161855254128622 0.00143967697258496 TRUE TRUE FALSE TRUE Aggregatibacter NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Neisseria -0.627568528165346 0.71670133868654 0.173653120868866 0.577654753484767 -3.61392023952886 1.2407088046328 0.00857929957151426 0.254680796289274 0.300275485002999 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Peptoniphilus -0.196834769915723 -0.36702559138904 0.427868930187526 0.490084995181442 -0.460035202437939 -0.748901914969174 0.690661058524596 0.532014362327924 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Parvimonas 2.15618914456876 -4.76581300744413 0.225598809809449 0.31681555678688 9.5576264182864 -15.0428629697943 0.000669425826136226 0.000113799834579639 0.0314630138284026 0.00651756125013907 TRUE TRUE TRUE TRUE Haemophilus 0.863157384508404 -4.86005604443086 0.201257272301782 0.306040749047643 4.28882581303255 -15.8804213476627 0.0502989576180445 0.00394186855852022 1 0.165558479457849 FALSE FALSE FALSE TRUE Desulfovibrio -1.2354766985674 1.62856359428962 0.237028301774753 0.737770816290316 -5.21235940736506 2.20741124252978 0.00123611953061418 0.0630376423143883 0.0531531398164099 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Lacrimispora 0.814819834729001 -1.44688120565498 0.11241989526827 0.301962773828831 7.24800385896622 -4.79158800705398 0.000170223274172416 0.00198548804402704 0.0086813869827932 0.091332450025244 TRUE FALSE TRUE TRUE Lachnospiraceae_[G-2] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Bacteroides -5.16118664761351 5.89566475994922 0.075857055780042 0.376755790221539 -68.0383201607387 15.6485047157005 1.29876717109818e-08 1.93696993140134e-05 1.01303839345658e-06 0.00137524865129495 TRUE TRUE TRUE TRUE Mollicutes_[G-2] -1.2179352482453 1.60225141880647 0.429329140695984 0.514453623671848 -2.8368334054169 3.11447202445694 0.0251585183221358 0.0169745599437468 0.754755549664073 0.560160478143646 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnospiraceae_[G-8] -2.35651324401364 3.31011841245897 0.170278949937799 0.296529917620207 -13.8391342257774 11.1628480492769 2.42936555955717e-06 1.03148599195598e-05 0.000172484954728559 0.000763299634047428 TRUE TRUE TRUE TRUE Serratia -3.83147244573381 5.52255721503923 0.812502916171301 0.921100810464094 -4.7156414696806 5.99560564088171 0.00216854500452725 0.000544640446203015 0.0889103451856173 0.0272320223101508 FALSE TRUE TRUE TRUE Veillonella -1.41958321771651 1.90472337301329 0.141165163752104 0.303400232890874 -10.0561865263685 6.27792323975694 2.06181436886983e-05 0.000412857062383193 0.00126365540390404 0.021468567243926 TRUE TRUE TRUE TRUE