taxon lfc_(Intercept) lfc_DayD22 se_(Intercept) se_DayD22 W_(Intercept) W_DayD22 p_(Intercept) p_DayD22 q_(Intercept) q_DayD22 diff_(Intercept) diff_DayD22 passed_ss_(Intercept) passed_ss_DayD22 Mogibacterium NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Schaalia 1.83319218098473 -3.82286774493683 0.191913738217552 0.527270722336458 9.55216754157867 -7.25029398180279 0.00243382903321835 0.00541294155705335 0.140865223233061 0.330189434980254 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-7] -1.20698166824312 3.21695296230807 0.16736800625754 0.55425463276212 -7.21154356338481 5.80410658234182 0.000799113613030901 0.00214068313906131 0.0519423848470086 0.145566453456169 FALSE FALSE TRUE TRUE Alloprevotella 1.306835234591 -3.74403215425387 0.1884459868619 0.488788814201683 6.93480002600799 -7.65981553888223 0.0201668368792882 0.0166199689084041 0.887340822688679 0.864238383237015 FALSE FALSE TRUE TRUE Bacteroidales_[G-2] 0.0197362024556495 1.07019668858523 0.197232225617305 0.478024991855346 0.100065810208643 2.23878815296142 0.924180475948297 0.0753291397058942 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Ruminococcaceae_[G-1] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Bifidobacterium 0.449057634019928 -0.748379410737293 1.08542158271455 1.23809161041796 0.413717251592577 -0.604462064390091 0.719225592249849 0.606975969472463 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Slackia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Solobacterium -2.5479549761556 5.56365625115491 0.221487462831311 0.493696990829793 -11.5038338675456 11.2693744432261 8.70076337602389e-05 9.61271875081765e-05 0.00661258016577815 0.00749792062563777 TRUE TRUE TRUE TRUE Gemella 0.582558641837912 0.0852574196662708 0.276523593896523 0.51379439043458 2.10672309595365 0.165936844102478 0.0889909588128039 0.874707753739902 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Peptostreptococcus -2.495055360426 5.47108192362811 0.247965892674279 0.483609033393106 -10.0620909332214 11.3130267340993 0.00016594646239149 9.43459158436867e-05 0.0119481452921873 0.00745332735165125 TRUE TRUE TRUE TRUE Eikenella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Ruminococcaceae_[G-2] -1.1063706883692 3.04088374752872 0.255358111169306 0.490632957725403 -4.33262402867501 6.19787908587795 0.00748080159310803 0.001595852155417 0.389001682841617 0.11170965087919 FALSE FALSE TRUE TRUE Veillonellaceae_[G-1] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Filifactor -0.252894180074098 1.54729985801229 0.139597227836002 0.486446806193514 -1.81159886907781 3.18082026300067 0.12980500071994 0.0245156793080806 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Granulicatella 2.14383167576542 -2.64697038970688 0.192264542161589 0.584219595502955 11.1504266551845 -4.53077988154112 0.000101188490341078 0.00622103601811462 0.00758913677558085 0.364277162655696 TRUE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-8] -1.02075896123814 2.89106322504936 0.189301082903405 0.581528258176284 -5.392251040418 4.97149224375778 0.00296078380090858 0.00420636100667353 0.165803892850881 0.260794382413759 FALSE FALSE TRUE TRUE Bacteroidetes_[G-3] -4.54652839058608 7.88088576904331 0.165206580781914 0.629546278821226 -27.5202620202391 12.5183581162605 1.03687828135376e-05 0.000234265557593394 0.000819133842269471 0.0180384479346913 TRUE TRUE TRUE TRUE Porphyromonas -1.19738768716146 3.20016349541517 0.258232896244555 0.548930835118373 -4.63685186734494 5.82981186459506 0.00564871261711956 0.00209903747841287 0.299381768707337 0.144833586010488 FALSE FALSE TRUE TRUE Kingella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Leptotrichia 1.45292876486563 -1.43789029563224 0.181279226914873 0.828493906453431 8.01486628993574 -1.73554721939655 0.000488634115753579 0.143164201689019 0.0326059750102979 1 TRUE FALSE FALSE TRUE Arachnia 1.41785138702832 -1.37650488441695 0.174169598086364 0.614675792269776 8.1406364980257 -2.23939986205413 0.000454193681587479 0.0752713226934886 0.0308851703479486 1 TRUE FALSE TRUE FALSE Lachnoanaerobaculum 0.395605007152743 0.412426280365316 0.196973719228011 0.548228235452818 2.0084151769242 0.752289381856931 0.100850109738027 0.48576306075049 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lautropia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Johnsonella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptococcus NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Tannerella -0.909067474051692 2.69560312247308 0.152932258667963 0.496706412721639 -5.94424931645981 5.42695454182454 0.00192481947148958 0.00287890664456872 0.115489168289375 0.187128931896967 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-1] 0.513440808986259 0.206213627156664 0.443562940224147 0.666116204596687 1.15753766247198 0.309576055549527 0.299340065654203 0.769369421540421 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Selenomonas 1.56234088587506 -6.08256841263872 0.154696291136433 0.48017031364159 10.0994075190669 -12.6675228347809 0.00966224604900882 0.00617418919755418 0.463787810352424 0.364277162655696 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-3] -0.778341695378742 2.46683300979541 0.192095244776875 0.442615682498954 -4.05185300803677 5.57330683781465 0.00980745802231516 0.00256156298280927 0.463787810352424 0.171624719848221 FALSE FALSE TRUE TRUE Bulleidia -1.8733752423383 4.38314171697465 0.285507380321717 0.558299898686402 -6.56156502934298 7.85087320862414 0.00123264712493362 0.000538314165735349 0.078889415995752 0.0403735624301512 FALSE TRUE TRUE TRUE Shuttleworthia 0.142535619742179 0.855297708333804 0.385967408914962 0.757101264075218 0.369294444167909 1.12970054194604 0.72703166033427 0.309865980757967 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Prevotella 0.795390826914652 -0.287198904218024 0.192637490053511 0.6099409360047 4.12895136192704 -0.470863467697814 0.00909426075614562 0.657564809017466 0.454713037807281 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Erysipelotrichaceae_[G-1] -0.303026141979718 1.63503079134712 0.183103332351281 0.571015120814902 -1.65494607929017 2.86337564759012 0.15883978528774 0.0352668478824127 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-9] 1.13243145969363 -4.362930707913 0.441538201179175 0.654174368421334 2.56474175205984 -6.66936969487463 0.124304443683486 0.0217509541588249 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Fusobacterium 1.42459183674067 -1.38830067141355 0.166863327239816 0.995202363850502 8.53747710959425 -1.39499334189895 0.000362949183532563 0.22181741365036 0.0250434936637469 1 TRUE FALSE FALSE TRUE Streptococcus -0.338464716007719 1.69704829589612 0.160020105794586 0.492125444740434 -2.11513868414884 3.44840591770502 0.0880463887493425 0.0182689991990179 1 0.913449959950896 FALSE FALSE TRUE TRUE Abiotrophia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Campylobacter NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Actinomyces 2.80177632173466 -4.58171601435531 0.355880908195545 0.684804453038406 7.87279187282273 -6.69054646772041 0.00140705065682426 0.00259562831783489 0.0886441913799282 0.171624719848221 FALSE FALSE TRUE TRUE Lancefieldella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] 0.00398455710153004 1.09776206795494 0.203114371897367 0.726069264593297 0.0196173075509567 1.51192471777447 0.985107423865152 0.190955905669374 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Phocaeicola -1.01573335721948 2.5846932189934 0.216955782466741 0.527597979340277 -4.68175286996642 4.8989824074485 0.00943540318698663 0.00804987619727293 0.462334756162345 0.458842943244557 FALSE FALSE FALSE TRUE Peptoanaerobacter -1.86371253721816 4.3662319830144 0.210473967219101 0.574435107960631 -8.85483635740118 7.60091422426368 0.00030536171344787 0.000626077227864416 0.0213753199413509 0.0463297148619668 TRUE TRUE TRUE TRUE Lacticaseibacillus NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Cardiobacterium NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Rothia -0.430812947422678 1.8586577008723 0.257387264600115 0.59035705129062 -1.6737927888235 3.14836199010237 0.155027069117568 0.0254257765429325 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptidiphaga NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Anaeroglobus NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Pseudoleptotrichia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Olsenella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] 2.58634023156896 -3.42136036236307 0.163236873870538 0.745625110004322 15.8440931282485 -4.58857985931192 1.82224805336649e-05 0.00590122769044829 0.00142135348162586 0.354073661426897 TRUE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-2] -0.943867920573461 5.25878046640398 0.183870328370519 0.487238381217563 -5.13333461107145 10.7930341063501 0.035916984782251 0.00847547716167986 1 0.474626721054072 FALSE FALSE FALSE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-2] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Oribacterium 0.642088601793737 -0.26234057447347 0.168910604554303 0.56470066643865 3.80135162909392 -0.464565724931671 0.0190814618224216 0.666402802453252 0.858665782008973 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Neisseria 0.867597682680919 -0.413560901808991 0.230677524022932 0.595364595427501 3.7610845978851 -0.694634691053527 0.0131428482401569 0.518232429493533 0.604571019047215 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Dialister 1.35981335768766 -1.84294263918389 0.18767187910544 0.50610420571414 7.24569586114538 -3.64142921235637 0.00192575403962987 0.021936919433983 0.115489168289375 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Weeksellaceae_[G-1] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Fretibacterium -1.53772685784147 3.7957570441052 0.272596634283684 0.529030010210705 -5.64103391034977 7.17493709400985 0.00242871074539761 0.000818129549259512 0.140865223233061 0.0589053275466849 FALSE FALSE TRUE TRUE Capnocytophaga 1.5817746388806 -1.66337057515844 0.260148361880145 0.539102385932003 6.08027906633274 -3.0854446549755 0.00173939058410795 0.0273002564859656 0.107842216214693 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Catonella 2.33801559354058 -3.79934711088972 0.196664566044338 0.487515272761998 11.8883418633404 -7.793288381233 0.000286716840082231 0.0014623123182914 0.0203568956458384 0.103824174598689 TRUE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-4] -2.03720595599286 4.66984546587013 0.146658902392502 0.520426965629322 -13.8907759621758 8.97310434370585 3.47418864526647e-05 0.000286727002544962 0.00267512525685518 0.0217912521934171 TRUE TRUE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-5] 2.03389591626262 -3.1911077563338 0.195974627561946 0.732013211784166 10.3783634726884 -4.35935814403675 0.000486656343437282 0.0120682013092134 0.0326059750102979 0.651682870697523 TRUE FALSE FALSE FALSE Lachnospiraceae_[G-3] 1.72068182458085 -1.90645815013387 0.165342680888396 0.747538907460868 10.4067613718099 -2.55031294171624 0.000141153888486276 0.0512465430546183 0.0104453877479844 1 TRUE FALSE TRUE FALSE Riemerella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Aggregatibacter NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptoniphilus -1.47895334736481 3.69290340077104 0.478569716494646 1.07790546004564 -3.09036133376266 3.42599934563342 0.0271483108006103 0.0187163241186728 1 0.917099881814969 FALSE FALSE FALSE TRUE Parvimonas 1.34506338974671 -5.21345842812531 0.280663662948398 0.536073282255822 4.79243866347603 -9.72527189974257 0.0408880341387879 0.0104081777279227 1 0.572449775035747 FALSE FALSE TRUE TRUE Haemophilus NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Treponema -0.536825425113686 2.04417953683157 0.193648313817948 0.532884498090734 -2.77216679314008 3.83606493368757 0.0392644309160601 0.0121723076144037 1 0.651682870697523 FALSE FALSE FALSE TRUE Corynebacterium 1.17938210309008 -0.959183637525022 0.274532915296395 1.79599664640442 4.29595883545249 -0.534067610563362 0.00774510395267736 0.616176522545237 0.395000301586545 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Desulfovibrio 0.576311406090955 -0.130786183067907 0.291541254683411 0.581260337292416 1.97677480230639 -0.22500448538623 0.119240911670991 0.833003190008943 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lacrimispora 1.27404818077133 -1.52625973242866 0.172923279764468 0.58904824597831 7.36770770544409 -2.59106065224556 0.00180834759228955 0.0606161137292942 0.110309203129663 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Lachnospiraceae_[G-2] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Bacteroides -3.43588454535858 5.39702442495107 0.138007481537344 0.675110751618676 -24.8963643643395 7.99428006739772 0.000142084362693801 0.00408501922719594 0.0104453877479844 0.257356211313344 TRUE FALSE TRUE TRUE Mollicutes_[G-2] -0.894554905606651 2.67020612769426 0.480057912700791 0.764723928232818 -1.863431227649 3.49172561379735 0.12143413257063 0.017438187858053 1 0.889347580760703 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnospiraceae_[G-8] -1.0822142662434 2.99861000880857 0.227524063153016 0.574822328301258 -4.75648268251776 5.21658582343209 0.00507523824502084 0.00341957117574641 0.274582779591103 0.218852555247771 FALSE FALSE TRUE TRUE Serratia -4.10749069390578 8.29284375721772 0.860197266178807 1.14033054864409 -4.77505667060788 7.27231570449318 0.00499241417438369 0.000768687018477614 0.274582779591103 0.0561141523488658 FALSE FALSE TRUE TRUE Veillonella 0.179145659341227 0.791230139035469 0.19988493876898 0.795854335631027 0.896243911344804 0.994189644525977 0.411191902176714 0.365777724266715 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE