taxon lfc_(Intercept) lfc_SourceBiofilm se_(Intercept) se_SourceBiofilm W_(Intercept) W_SourceBiofilm p_(Intercept) p_SourceBiofilm q_(Intercept) q_SourceBiofilm diff_(Intercept) diff_SourceBiofilm passed_ss_(Intercept) passed_ss_SourceBiofilm Veillonella dispar (SP10) 0.347170742938694 -0.34365695908754 0.070650188672234 0.325610853343233 4.91393936043563 -1.05542231027933 1.17268356198541e-05 0.296744097742566 0.000902966342728769 1 TRUE FALSE FALSE TRUE Haemophilus pittmaniae (SP101) -1.14789772880849 2.61611101707024 0.107151713311531 0.298666971271203 -10.7128266392821 8.75929134693201 5.75664360347033e-14 2.78033403617467e-11 6.21717509174796e-12 2.86374405725991e-09 TRUE TRUE TRUE TRUE Fusobacterium nucleatum (SP103) -1.19178218100287 2.73424888879559 0.0713742216565628 0.253317820759071 -16.6976557269859 10.7937486616708 3.76514991044805e-21 3.39196973239775e-14 4.89469488358247e-19 4.3756409547931e-12 TRUE TRUE TRUE TRUE Actinomyces graevenitzii (SP104) 1.28855524215085 -2.22642595751184 0.075053181442482 0.20150420954803 17.1685625763692 -11.0490295091387 1.24570569845048e-21 1.55162676188078e-14 1.65678857893914e-19 2.06366359330144e-12 TRUE TRUE TRUE TRUE Capnocytophaga gingivalis (SP107) -0.0660143673438348 -0.799239368083861 0.0744608707283064 0.157993562480969 -0.886564536489355 -5.0586831231186 0.384489903010412 4.0332146695871e-05 1 0.00241992880175226 FALSE TRUE FALSE TRUE Ruminococcaceae_[G-1] bacterium_HMT_075 (SP108) 0.0601667086571877 -1.11620121721761 0.113911048888284 0.185135568473003 0.528190278681352 -6.02910195174289 0.602024881046925 2.68143743106751e-06 1 0.000179656307881523 FALSE TRUE FALSE TRUE Streptococcus sp._HMT_056 (SP109) -0.195335718512025 0.752740066884366 0.168422738827244 0.280135853830804 -1.15979421705276 2.6870536441187 0.252683487323195 0.0102847096793243 1 0.35996483877635 FALSE FALSE TRUE FALSE Veillonella parvula (SP11) -0.401518032071011 1.15372059093187 0.0491472567327479 0.184888147151511 -8.16969366681805 6.24010034556962 1.66454981988612e-10 1.26305694641082e-07 1.6312588234884e-08 9.85184418200441e-06 TRUE TRUE TRUE TRUE Lachnoanaerobaculum orale (SP110) 0.299301431398946 -1.14624478012162 0.154930924016137 0.229341586359983 1.93183790324372 -4.99798051593848 0.0628730214067561 2.34299014139627e-05 1 0.00142922398625173 FALSE TRUE FALSE TRUE Prevotella melaninogenica (SP111) 0.858757432337115 -1.36683033788438 0.0519258211561466 0.151481039626477 16.5381579571893 -9.02311167955223 5.50445263537719e-21 9.63203319893852e-12 7.10074389963657e-19 1.06915568508218e-09 TRUE TRUE TRUE TRUE Aggregatibacter sp._HMT_458 (SP116) -0.0707045630531518 0.407363961895247 0.0653838991790334 0.189053874605686 -1.08137575061942 2.15475066430083 0.288755992689857 0.0399302041904219 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Fusobacterium hwasookii (SP117) -1.80431444278199 2.70459880856814 0.0983135509921941 0.451065997236626 -18.3526525547353 5.99601571640818 3.81718062389671e-17 1.84978439819694e-06 4.61878855491501e-15 0.000125785339077392 TRUE TRUE TRUE TRUE Campylobacter concisus (SP12) -0.925752753879214 2.20219003454828 0.0515724856073429 0.149235941511927 -17.9505165007483 14.7564320782087 2.08366551497304e-22 4.61150624004437e-19 2.85462175551307e-20 6.73279911046478e-17 TRUE TRUE TRUE TRUE Prevotella pallens (SP121) 0.930791059441979 -3.68528148298967 0.0682239626735528 0.169566030005528 13.6431691002142 -21.7336071550978 2.11815278801876e-14 6.51630012517497e-20 2.32996806682064e-12 9.64412418525895e-18 TRUE TRUE TRUE TRUE Prevotella salivae (SP125) 0.738678564923208 -1.26025129700077 0.0389519357149488 0.197258514777928 18.9638474023185 -6.38883091267083 1.66037949772315e-22 9.93539818545777e-08 2.29132370685794e-20 7.94831854836622e-06 TRUE TRUE TRUE TRUE Actinomyces sp._HMT_169 (SP126) 0.850254581430796 -1.47012621188022 0.0889601731730014 0.207021927329362 9.5576992614133 -7.10130675936234 3.34579573565906e-12 9.1823637458191e-09 3.44616960772883e-10 8.172303733779e-07 TRUE TRUE TRUE TRUE Aggregatibacter aphrophilus (SP13) -1.76012603992903 3.23479953266237 0.152773188217593 0.3756424199937 -11.5211710933342 8.61137976034926 8.43513308471677e-14 2.28762054786543e-10 9.02559240064694e-12 2.31049675334408e-08 TRUE TRUE TRUE TRUE Actinomyces sp._HMT_175 (SP130) 0.458834234349678 -0.869929946376644 0.0634665522272046 0.152881778435798 7.22954403930897 -5.69021341377165 1.20549008204662e-08 1.51477783634714e-06 1.10905087548289e-06 0.000104519670707953 TRUE TRUE TRUE TRUE Gemella sanguinis (SP131) -0.271880755309763 0.894446037409375 0.0687377975694093 0.154639006835876 -3.95533119947909 5.78409067486241 0.000261993419712037 6.09391054762874e-07 0.0183395393798426 4.32667648881641e-05 TRUE TRUE TRUE TRUE Campylobacter sp._HMT_044 (SP132) -0.358368508950132 1.17616564453064 0.0979753863263731 0.223385261213957 -3.65774019768949 5.26518910933931 0.000936223265178093 1.00395639174557e-05 0.059918288971398 0.000632492526799711 FALSE TRUE FALSE FALSE Streptococcus sp._HMT_061 (SP135) 1.31882039054537 -2.34614724563514 0.118489140944888 0.241788959770594 11.1303059506422 -9.7032852445419 1.6348130032343e-14 1.32459197001344e-12 1.81464243359007e-12 1.576264444316e-10 TRUE TRUE TRUE TRUE Haemophilus haemolyticus (SP14) 0.222952792099583 -0.172727886080164 0.0831276404419977 0.210442840192552 2.68205365765372 -0.820782906760436 0.0105833585261104 0.416634842017271 0.5080012092533 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Neisseria subflava (SP140) -2.24728665214278 3.69240288741965 0.131153478963989 0.269438436867489 -17.1347849092117 13.7040688416538 5.43667577412137e-18 3.56316745275856e-15 6.68711120216929e-16 4.84590773575164e-13 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus oralis (SP143) -0.190216680591453 0.731117887972755 0.059918117147307 0.200542970325833 -3.17461044584913 3.64569192719579 0.00267633713948023 0.00067674024311731 0.144522205531932 0.0311300511833963 FALSE TRUE FALSE TRUE Lautropia mirabilis (SP144) 0.265551244244466 -0.27752266041267 0.0996124175884988 0.211514212318563 2.66584478796072 -1.31207571051865 0.0109372679565916 0.196793475468288 0.514051593959807 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Prevotella sp._HMT_306 (SP145) 0.5303891329494 -4.30585048461471 0.0547767148199326 0.162372711321047 9.68274812925432 -26.5183136352332 8.82398453232557e-09 1.79009818401607e-16 8.29454546038604e-07 2.48823647578234e-14 TRUE TRUE TRUE TRUE Catonella morbi (SP148) -0.150069417044429 0.650823360878708 0.0759233339188931 0.200415637998478 -1.97659150749023 3.24736815638933 0.0541011111119601 0.00217737999735629 1 0.0849178198968955 FALSE FALSE TRUE TRUE Prevotella jejuni (SP149) 0.876093338549665 -2.16572689552353 0.153981791139508 0.226383531710343 5.68959051629632 -9.56662739184834 1.80674753120451e-06 2.00182791258004e-11 0.000144539802496361 2.12193758733484e-09 TRUE TRUE TRUE TRUE Stomatobaculum longum (SP15) -0.62090422954695 1.59249298588375 0.0947159756452743 0.249041260380257 -6.55543297017106 6.39449456468459 4.24058728928405e-08 7.40270631744908e-08 3.82638259508956e-06 5.99619211713376e-06 TRUE TRUE TRUE TRUE Parvimonas sp._HMT_110 (SP151) -3.43368551721246 5.21361036627404 0.0536936516437458 0.188780886079929 -63.9495622312069 27.6172576288609 1.06796855300231e-19 2.81792265186911e-14 1.36699974784296e-17 3.66329944742984e-12 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus sp._HMT_057 (SP152) 0.492394002884093 -0.736965609730712 0.15185665052611 0.289671467414286 3.24249218706052 -2.54414290889309 0.00232419443370847 0.0147214815765515 0.130154888287674 0.50053037360275 FALSE FALSE TRUE TRUE Granulicatella elegans (SP153) 0.956548163948562 -2.38635507431057 0.160241959929039 0.232999252665674 5.96939880398466 -10.2419001220347 7.63542266426093e-07 3.26769087695027e-12 6.26104658469396e-05 3.75784450849281e-10 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus sp._HMT_423 (SP154) -0.481825012777781 1.31433455234541 0.0453150034498185 0.147027017918412 -10.632792146013 8.93940835469273 5.57803558928137e-14 1.26959689141665e-11 6.08005879231669e-12 1.39655658055831e-09 TRUE TRUE TRUE TRUE Neisseria perflava (SP156) 0.0245280415475576 0.301628443694735 0.048299547244191 0.22410157442848 0.507831707480604 1.34594522356199 0.613997902405214 0.18491642179538 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Schaalia sp._HMT_172 (SP158) 0.978388710421672 -1.65207127243879 0.0456214182760749 0.222548684404674 21.4458196915541 -7.42341513659424 2.93091801438511e-25 2.41055207434388e-09 4.27914030100226e-23 2.24181342913981e-07 TRUE TRUE TRUE TRUE Selenomonas sp._HMT_136 (SP161) 0.411056520524063 -2.14916285550433 0.131964904478505 0.198001057129439 3.11489272203443 -10.8542999045675 0.00421933581661185 1.52880612659313e-11 0.219405462463816 1.63582255545465e-09 FALSE TRUE TRUE TRUE Pseudoleptotrichia sp._HMT_221 (SP162) 0.0388765551932471 -3.32919101416707 0.141059778367221 0.204697600930924 0.275603404763899 -16.2639473986338 0.785313691212708 4.15164814609954e-14 1 5.31410962700741e-12 FALSE TRUE FALSE TRUE Prevotella vespertina (SP164) 0.134262789428296 -2.69045999806927 0.22413896020907 0.275425575494642 0.59901584848551 -9.76837388190048 0.554775031133639 7.75316604855416e-10 1 7.59810272758307e-08 FALSE TRUE FALSE TRUE Capnocytophaga sputigena (SP165) -0.0426180105654349 -1.55261235654932 0.0772821840508454 0.160357553979502 -0.55145970690212 -9.68219031794277 0.586876643955806 2.16545445237795e-09 1 2.03552718523527e-07 FALSE TRUE FALSE TRUE Alloprevotella tannerae (SP167) 0.411031296687276 -1.4625291496612 0.0656577840910841 0.169665563315568 6.26020665146224 -8.62007069131042 5.86471428625936e-07 9.80037283932112e-10 4.86771285759527e-05 9.50636165414149e-08 TRUE TRUE TRUE TRUE Prevotella scopos (SP168) -0.0699871521850965 -0.973483792658056 0.12729090318221 0.196159214153737 -0.549820532618218 -4.96272273957573 0.588847921729767 8.64055601253729e-05 1 0.00483871136702088 FALSE TRUE FALSE TRUE Fusobacterium nucleatum_subsp._animalis (SP170) -0.287039135508242 1.21467489519395 0.0440201423228854 0.157355375288225 -6.52063170088878 7.71930982954379 0.000620619551153175 0.000247929467922071 0.0415815099272627 0.0131402617998698 TRUE TRUE FALSE FALSE Neisseria sicca (SP175) -1.35272860613352 2.74633438365246 0.113059069451403 0.343770120534589 -11.9647951526346 7.98886878063078 7.64973259445384e-12 2.41013900233672e-08 7.80272724634292e-10 2.04861815198621e-06 TRUE TRUE FALSE TRUE Aggregatibacter segnis (SP178) -2.55881751275818 5.05790552598528 0.11729740230672 0.301782952929753 -21.8147841506938 16.7600769920315 1.56519239830352e-24 3.26832817143213e-20 2.25387705355707e-22 4.86980897543387e-18 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus australis (SP179) 1.03826031758865 -1.72583610838744 0.0815519262305018 0.24419704702542 12.7312788989688 -7.06739139318007 1.10608222428342e-16 7.22071008176800e-09 1.32729866914011e-14 6.4986390735912e-07 TRUE TRUE TRUE TRUE Eikenella corrodens (SP18) -1.92318175497266 2.76142404714653 0.0429332041252048 0.291178439029389 -44.7947409041297 9.48361443364913 7.02837618026256e-27 4.37333523503024e-10 1.04019967467886e-24 4.32960188267994e-08 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus anginosus (SP181) 0.0778181759383628 -0.147436419857327 0.19401207225635 0.270824524904401 0.401099658559087 -0.544398332866533 0.692048823315718 0.591406857914019 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_071 (SP183) -0.924202667311918 2.19908986141369 0.106751861349236 0.350020824600093 -8.65748527127236 6.2827400738976 3.23629885435291e-11 1.08982854502172e-07 3.23629885435291e-09 8.60964550567158e-06 TRUE TRUE TRUE TRUE Haemophilus parahaemolyticus (SP188) 0.0556609078904993 -1.70393272819403 0.105406808610539 0.179532801145912 0.528057993826161 -9.49092710255876 0.602517244166087 2.02971654777282e-09 1 1.92823072038418e-07 FALSE TRUE FALSE TRUE Gemella morbillorum (SP19) -1.33158954979355 2.85804951914142 0.096829880615584 0.213876013843037 -13.7518454151563 13.3631138330403 2.41004163644002e-17 6.5796723355966e-17 2.94025079645683e-15 9.2773379931912e-15 TRUE TRUE TRUE TRUE Fusobacterium nucleatum_subsp._vincentii (SP190) -0.0332523207529496 -0.846175514450882 0.116907190191486 0.190761323926241 -0.284433495480343 -4.43578130532403 0.779967243772217 0.000481192720417679 1 0.0235784433004663 FALSE TRUE FALSE TRUE Fusobacterium sp._HMT_248 (SP191) -0.542593442885203 1.69004304761775 0.131796268721428 0.227047033554821 -4.11691050246695 7.44358127546151 0.000324615081813571 5.23970319557311e-08 0.0223984406451364 4.29655662036995e-06 TRUE TRUE FALSE FALSE Rothia aeria (SP194) 0.691964642547324 -1.0332447583048 0.110112215072399 0.235792518170644 6.2841769379751 -4.38200824318367 1.08442388865719e-07 6.75368193436133e-05 9.32604544245184e-06 0.00391713552192957 TRUE TRUE TRUE TRUE Neisseria flavescens (SP198) -1.39397639513768 3.1386373170652 0.0770721819795257 0.236302459889295 -18.0866346239943 13.282287956442 1.53550635546011e-22 2.36948464998955e-17 2.13435383408955e-20 3.41205789598495e-15 TRUE TRUE TRUE TRUE Neisseria elongata (SP199) -0.491805951722734 1.35186936948265 0.153569942644607 0.424344476203363 -3.20248834669996 3.18578288464577 0.00250249405041012 0.00262306851864678 0.137637172772557 0.0996766037085776 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-7] bacterium_HMT_922 (SP2) -1.7680124000885 2.65925381412751 0.0449528857257739 0.234856077410042 -39.3303426808661 11.3229082400309 1.07464094750354e-24 1.50153095559903e-11 1.55822937388013e-22 1.62165343204695e-09 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_070 (SP20) -0.32693406383973 1.00455265446931 0.12922220551794 0.281577856636709 -2.53001457860384 3.56758399423922 0.0148938890031765 0.00085521123699296 0.67022500514294 0.0384845056646832 FALSE TRUE FALSE TRUE Streptococcus intermedius (SP200) 0.178061743308742 -0.0118487260276487 0.0870976532288303 0.292956655869453 2.04439197507335 -0.0404453211431002 0.0467919796731382 0.967917014155469 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Neisseria cinerea (SP205) 0.11669651116515 -0.256596828248865 0.168523326163498 0.248948444111841 0.692465036275952 -1.03072276335894 0.49380026974616 0.310645908007154 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Lancefieldella parvula (SP207) 0.920914365475956 -1.49114420416206 0.0742435479001457 0.162106611042082 12.4039649440588 -9.19854035918971 2.81289197253042e-16 5.41270957443928e-12 3.3473414473112e-14 6.11636181911639e-10 TRUE TRUE TRUE TRUE Schaalia meyeri (SP208) 0.986857046107891 -1.72817336668299 0.196277447435261 0.437863985800926 5.02786774029855 -3.94682692051476 8.79355918126354e-06 0.000281597958511717 0.000685897616138556 0.0143614958840976 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus oralis_subsp._dentisani_clade_058 (SP21) 0.122363120741366 0.105958285307119 0.0526122614084648 0.152562722618798 2.32575292271467 0.69452277390115 0.0244948116681054 0.490847568322341 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Ruminococcaceae_[G-2] bacterium_HMT_085 (SP212) 0.134274355330812 -0.784928804053286 0.0816794898557697 0.17024517786447 1.64391765384327 -4.6105787776154 0.111376582185093 8.03798263973254e-05 1 0.00458165010464755 FALSE TRUE FALSE TRUE Prevotella nigrescens (SP215) -0.0126748728614354 -2.20593626099483 0.079822660426231 0.161136195130415 -0.158787903005926 -13.6898867396581 0.875222018178405 1.52728645366065e-12 1 1.80219801531957e-10 FALSE TRUE FALSE TRUE Haemophilus sp._HMT_036 (SP218) 0.0243242584595673 0.290738692413208 0.0671920086203645 0.156666817620921 0.362011181969564 1.85577709963251 0.719249218814692 0.0708638048136609 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus cristatus_clade_578 (SP22) -0.656025062344602 1.66273465147905 0.115486312217221 0.227435413987547 -5.68054386489257 7.31079923889993 8.69828934662483e-07 3.12102494538505e-09 7.04561437076611e-05 2.87134294975424e-07 TRUE TRUE TRUE TRUE Alloscardovia omnicolens (SP229) -0.604520697859695 1.46498163473508 0.0865733361731223 0.215478683536065 -6.98275848640999 6.79873113523031 1.35974658847807e-07 2.19597560969611e-07 1.15578460020636e-05 1.66894146336904e-05 TRUE TRUE FALSE FALSE Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] bacterium_HMT_875 (SP230) 0.0271266080679405 -0.11764851262698 0.0613065092144182 0.151595390354763 0.442475169693087 -0.776069195452842 0.661669841970822 0.444453521911062 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcus stomatis (SP241) 0.00903553646435747 0.311599927023007 0.0543545186817006 0.507585720832851 0.166233400340999 0.613886313649114 0.868717937278079 0.542381560393564 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Haemophilus sputorum (SP242) 0.19130328535138 -0.0319220439129104 0.0547668374078779 0.235614405578797 3.49304970682609 -0.135484262239792 0.00106693927820389 0.892820154662208 0.0661502352486414 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Corynebacterium argentoratense (SP244) 0.540040849549577 -0.929705590251169 0.0354452403854788 0.175583364662547 15.2359200749227 -5.2949525829965 9.85039877952921e-08 0.000497164437948154 8.56984693819041e-06 0.0238638930215114 TRUE TRUE FALSE FALSE Kingella oralis (SP245) 0.276913967621438 -0.737621765873095 0.0760546612028539 0.174347855076077 3.64098614393732 -4.23074757960878 0.000948858083429114 0.000182378137544639 0.059918288971398 0.00984841942741051 FALSE TRUE TRUE TRUE Streptococcus periodonticum (SP247) 0.632179890027832 -1.88447852422307 0.180708786216189 0.24982749879443 3.49833510182249 -7.54311888529816 0.00136161584167888 1.12288730464952e-08 0.0816969505007326 9.65683081998588e-07 FALSE TRUE TRUE TRUE Neisseria flava (SP249) -1.49837779125288 3.34744010929561 0.0579939326879506 0.273677139817242 -25.8368026068389 12.2313471688976 4.97569428525308e-29 4.62726718103258e-16 7.51329837073215e-27 6.33935603801464e-14 TRUE TRUE TRUE TRUE Stomatobaculum sp._HMT_097 (SP25) -0.386572583783321 1.14598989293161 0.0792367452588835 0.321529137005206 -4.87870346668463 3.56418675957524 1.37615390315302e-05 0.000878124503426894 0.00104587696639629 0.0386374781507833 TRUE TRUE FALSE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-3] bacterium_HMT_351 (SP257) -0.378932245082998 1.2732587590092 0.0782926029040324 0.15669873687904 -4.83994951026824 8.12552024584642 2.76716231872036e-05 1.7805597895977e-09 0.00202002849266586 1.70933739801379e-07 TRUE TRUE TRUE TRUE Solobacterium moorei (SP27) 0.187042255775294 -0.0233999847607377 0.0591346293679556 0.197985640537113 3.16299024403204 -0.118190312677506 0.00276539590655673 0.906431466617028 0.146565983047507 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Actinomyces sp._HMT_170 (SP272) 0.110482404562966 0.00612395999620024 0.0807304150993658 0.171718272912034 1.36853507351573 0.0356628324542802 0.179625017008398 0.971748224812894 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Parvimonas micra (SP277) 0.558776966754762 -3.30776161586191 0.109362516266659 0.184930162610059 5.10940115342895 -17.8865446781476 2.51839708685696e-05 3.92486198270044e-16 0.00186361384427415 5.41630953612661e-14 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus oralis_subsp._dentisani_clade_398 (SP281) -0.0116153095877569 0.299662572356849 0.143069420568433 0.21309084258366 -0.0811865284811229 1.40626677675837 0.935892446067873 0.171050285404795 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptococcus sp._HMT_168 (SP284) -0.0406981397111785 -1.20448628819253 0.0703822070457174 0.157217126222907 -0.578244721492503 -7.66129185242054 0.569248745538842 1.63605670876446e-07 1 1.25976366574863e-05 FALSE TRUE FALSE TRUE Prevotella shahii (SP286) 0.255063900184465 -0.506076905303452 0.0751988158268807 0.21190993514987 3.39186059487507 -2.38816978989464 0.00173613943379724 0.0224612058247343 0.10069608716024 0.718758586391497 FALSE FALSE TRUE TRUE Leptotrichia sp._HMT_215 (SP29) -0.135456807795107 0.621598142380064 0.0516895470929007 0.150165811881739 -2.6205841492798 4.13941185807057 0.0118554370773631 0.000146887727273578 0.545350105558705 0.00807882500004678 FALSE TRUE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-1] [Eubacterium]_sulci (SP292) 0.0776608359288581 -0.0965204840263683 0.0685162885910646 0.167996074104926 1.13346530475946 -0.574540116729658 0.264948303437048 0.569384638215941 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Neisseria oralis (SP296) -0.377643954396136 1.04499291455025 0.076672739526494 0.214415183954221 -4.92540056255121 4.87368895839654 5.61260002614473e-05 6.38183296485241e-05 0.00404107201882421 0.00376528144926292 TRUE TRUE FALSE TRUE Schaalia lingnae (SP3) 0.364828019702065 -1.81301720608409 0.0490369693958037 0.143677767315074 7.43985658569848 -12.618634322931 4.20481603855995e-08 4.50926826668098e-13 3.82638259508956e-06 5.5013072853508e-11 TRUE TRUE TRUE TRUE Haemophilus parainfluenzae (SP30) -0.457379809415742 1.26544414562133 0.0390013854357875 0.250113610142819 -11.7272708214117 5.05947735070772 2.02351882605571e-15 7.19785494998579e-06 2.30681146170351e-13 0.000460662716799091 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus vestibularis (SP305) 0.0905516544130726 -0.0205768936761951 0.0720469239895547 0.1679362430658 1.2568427546775 -0.122528010038505 0.216687304903478 0.903143983512198 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Fusobacterium sp._HMT_204 (SP309) -0.948307001478705 2.24729852974726 0.127660469497305 0.256026622933414 -7.42835276427308 8.77759704830275 2.08360121892563e-09 2.17004999151869e-11 1.97942115797935e-07 2.27855249109463e-09 TRUE TRUE TRUE TRUE Prevotella nanceiensis (SP31) 0.881549923474803 -2.71113789560603 0.0785382979688766 0.166575612305174 11.2244592291031 -16.2757192249674 8.31117242137503e-13 2.4928411799087e-17 8.72673104244378e-11 3.56476288726944e-15 TRUE TRUE TRUE TRUE Veillonella rogosae (SP32) 0.0760330102933828 0.198618506203084 0.0738910681313528 0.201973306499902 1.02898783596175 0.983389882777308 0.308865770908485 0.330559839481712 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Streptococcus cristatus (SP33) -0.326595093997901 1.06525396679385 0.0809409541358648 0.274179762494719 -4.03497954137889 3.88523922079905 0.000707355695484734 0.000995821657932071 0.0466854759019925 0.0408286879752149 TRUE TRUE FALSE FALSE Streptococcus mitis (SP34) 1.00602124031415 -1.66135795383846 0.0455291290660573 0.179705062991589 22.0962109522135 -9.24491456268106 3.91155456329904e-26 4.65048325411711e-12 5.74998520804959e-24 5.30155090969351e-10 TRUE TRUE TRUE TRUE Schaalia sp._HMT_180 (SP35) 0.249013496892975 -0.390223311071207 0.18530968372662 0.284178097492332 1.34376947758615 -1.37316462638975 0.18767011807201 0.178434908974154 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus gordonii (SP37) -1.28017967617969 2.91104387914923 0.105458161157574 0.189913331142315 -12.1392186448886 15.3282755962391 6.04473702690852e-16 1.07156919373153e-19 7.01189495121389e-14 1.57520671478534e-17 TRUE TRUE TRUE TRUE Porphyromonas catoniae (SP38) -1.37222889387955 3.0319957468269 0.0915135484585441 0.189231054822787 -14.9948168002814 16.0227175696205 4.94654843549099e-13 1.29354788664522e-13 5.24334134162045e-11 1.61693485830652e-11 TRUE TRUE FALSE FALSE Streptococcus parasanguinis_clade_411 (SP39) 1.08272605643935 -1.81476758608885 0.0571757530344207 0.207737513517486 18.9368044840185 -8.73586843011916 2.3715209178183e-23 2.49287444160969e-11 3.32012928494562e-21 2.59258941927407e-09 TRUE TRUE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_352 (SP4) 0.955843795144494 -1.6473508584764 0.054641882214676 0.163922524799043 17.4928782904877 -10.0495698226704 1.95890013269887e-21 5.73478420950614e-13 2.58574817516251e-19 6.93908889350242e-11 TRUE TRUE TRUE TRUE Corynebacterium durum (SP41) 0.0789852453687294 -2.0729649132372 0.0478858259419202 0.146286558466712 1.64944936868227 -14.1705768114636 0.112084862652855 3.72142522071501e-13 1 4.57735302147947e-11 FALSE TRUE FALSE TRUE Streptococcus sp._HMT_066 (SP49) 1.08260513621645 -1.81452574564305 0.0607409706613618 0.169238933421224 17.8233097763963 -10.7216803424707 2.77596335501843e-22 4.23643974572506e-14 3.74755052927488e-20 5.38027847707082e-12 TRUE TRUE TRUE TRUE Porphyromonas pasteri (SP5) -0.0885805489426974 0.527845624675245 0.0716806449981593 0.266858880416795 -1.23576662772736 1.97799535039204 0.222819078675844 0.0539372924995888 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Streptococcus chosunense (SP50) 0.867183550841954 -1.45979468549565 0.0431385852854313 0.14286409087744 20.1022714376036 -10.218065831168 8.4110283205795e-24 3.42022057909878e-13 1.19436602152229e-21 4.24107351808249e-11 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus infantis_clade_431 (SP52) 0.870096235013483 -1.38950794323712 0.0587560331943221 0.140549472559316 14.8086279435482 -9.88625512380132 4.03010952908272e-19 5.84887815533565e-13 5.07793800664423e-17 7.01865378640278e-11 TRUE TRUE TRUE TRUE Capnocytophaga leadbetteri (SP53) -0.0417136420506493 -1.17911330732604 0.0996320579578259 0.175160823233722 -0.41867690887512 -6.73160405139632 0.67970327110962 1.1651442331521e-06 1 8.15600963206467e-05 FALSE TRUE FALSE TRUE Prevotella denticola (SP57) -0.0126580912162856 -1.35279004076827 0.0900209865985206 0.171495189791208 -0.140612669273874 -7.88820982334999 0.889828613702163 4.41840584672162e-07 1 3.31380438504121e-05 FALSE TRUE FALSE TRUE Aggregatibacter sp._HMT_513 (SP58) -2.14004910854389 3.96705471618774 0.110173612916595 0.323925182336949 -19.4243344834663 12.2468240584679 2.48804652889887e-21 9.18499867925726e-15 3.25934095285752e-19 1.23997482169973e-12 TRUE TRUE TRUE TRUE Actinomyces oris (SP60) 0.279676384151372 -0.243954454273447 0.14643735512835 0.219273911212607 1.90987049654263 -1.11255576609344 0.0628350291404844 0.272080577755039 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Abiotrophia defectiva (SP61) 0.361000184791677 -0.431823559969976 0.109936652661545 0.19023012183104 3.28371090125024 -2.27000622095756 0.00201347076732482 0.0281588720028103 0.114767833737515 0.84476616008431 FALSE FALSE TRUE TRUE Alloprevotella sp._HMT_473 (SP62) 0.490632931744909 -1.81903528418064 0.130943939490152 0.195447976588317 3.74689301127838 -9.30700494286607 0.000761706231261039 2.37112798348985e-10 0.0495109050319675 2.37112798348985e-08 TRUE TRUE TRUE TRUE Aggregatibacter sp._HMT_512 (SP63) -2.35852095321173 4.07413187716301 0.121823450669483 0.534445838756856 -19.360155538613 7.62309589057633 3.12403689463914e-19 1.09737639666779e-08 3.96752685619171e-17 9.54717465100974e-07 TRUE TRUE TRUE TRUE Actinomyces naeslundii (SP64) -0.0430097876634694 -1.27949819111542 0.118969518758971 0.18769547446926 -0.361519388429285 -6.81688354358787 0.72101115638632 5.95166567239633e-07 1 4.28519928412535e-05 FALSE TRUE FALSE TRUE Gemella haemolysans (SP66) 0.62937031591161 -0.90805610503337 0.0516340563852399 0.136496030566358 12.1890542787477 -6.65261913672951 5.230479283998e-16 3.02914583112225e-08 6.11966076227766e-14 2.54448249814269e-06 TRUE TRUE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] bacterium_HMT_870 (SP69) 0.611299163037759 -2.37516304531995 0.0862766397064242 0.170466641099305 7.08533810679047 -13.9333011432795 7.04285236968884e-08 1.22463989422553e-14 6.19771008532618e-06 1.64101745826221e-12 TRUE TRUE TRUE TRUE Fusobacterium periodonticum (SP7) -0.719740689440585 1.79016590567102 0.0495010956554492 0.163986927130361 -14.5398941156842 10.9165159503716 8.09294078659043e-19 2.32620997355261e-14 1.0116175983238e-16 3.04733506535392e-12 TRUE TRUE TRUE TRUE Veillonella tobetsuensis (SP71) 0.108764325333495 0.13315587612286 0.149377139458926 0.246185763838628 0.72811894596095 0.540875613791148 0.470231164071023 0.591203046580781 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Rothia mucilaginosa (SP77) 0.547036369821681 -0.743388212853512 0.0457138311030633 0.209812390583979 11.9665395925441 -3.54310920715601 1.0004037111467e-15 0.000919858137292984 1.1504642678187e-13 0.0395538999035983 TRUE TRUE TRUE TRUE Neisseria mucosa (SP78) -0.468635496070587 1.29290262778542 0.13823460347906 0.246740336747654 -3.39014605804961 5.2399321684792 0.00148438000662647 4.34901932881675e-06 0.0875784203909616 0.000282686256373089 FALSE TRUE FALSE FALSE Granulicatella adiacens (SP8) 0.295467112494974 -0.240249698200098 0.05015127127092 0.166653914243332 5.89151790188616 -1.44160849321132 4.20972553977504e-07 0.156186534911228 3.53616945341104e-05 1 TRUE FALSE TRUE FALSE Streptococcus salivarius (SP80) 0.187203017505748 -0.0237215082216445 0.0499664580840653 0.13281693602293 3.74657369531359 -0.178603037624277 0.000498548513744214 0.859033707914248 0.0339012989346065 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Campylobacter showae (SP81) -0.880245968431278 1.87583140655638 0.0945839248278776 0.199613177850159 -9.30650710501955 9.39733251461229 1.88111283253657e-11 1.44356497738288e-11 1.89992396086193e-09 1.57348582534734e-09 TRUE TRUE TRUE TRUE Veillonella sp._HMT_780 (SP82) 0.29717481721349 -0.593614996163059 0.176419789333164 0.250610636262155 1.68447552475127 -2.36867439074733 0.102133720923133 0.0242656822331872 1 0.752236149228804 FALSE FALSE FALSE TRUE Prevotella histicola (SP83) 1.37551184635959 -2.40033916592932 0.057342677383397 0.147425365073704 23.9875762542935 -16.2817244151255 1.20229555167662e-27 1.01928349789154e-20 1.79142037199816e-25 1.52892524683731e-18 TRUE TRUE TRUE TRUE Schaalia odontolytica (SP84) 0.816618918173191 -1.28255330955653 0.0455613781642877 0.219256299795955 17.9234902690735 -5.84956195443462 2.21432569078128e-22 4.86438106587429e-07 3.01148293946254e-20 3.59964198874698e-05 TRUE TRUE TRUE TRUE Veillonella atypica (SP86) -0.339477216121214 1.02963895903228 0.0719001238535581 0.148022432125625 -4.72151086711118 6.95596568875748 2.22371691924869e-05 1.06091505559947e-08 0.00166778768943652 9.33605248927537e-07 TRUE TRUE TRUE TRUE Mogibacterium diversum (SP87) 0.660254006821767 -1.8442999967051 0.0609405121942473 0.171769950809702 10.83440199382 -10.7370351333938 1.44072648462072e-12 1.83044973556718e-12 1.49835554400555e-10 2.1416261906136e-10 TRUE TRUE TRUE TRUE Rothia dentocariosa (SP88) 0.0038476733117371 0.342989180166376 0.0756994812797001 0.27048691893004 0.0508282652231187 1.2680435028915 0.959682442933423 0.21116308278911 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Streptococcus sp._HMT_074 (SP89) 1.00718842605997 -2.44360475748568 0.0722519685741261 0.169460314381913 13.9399444186306 -14.4199234280808 4.43600601206304e-16 1.57045512681938e-16 5.23448709423438e-14 2.19863717754714e-14 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus sp._HMT_064 (SP90) 0.257348973485862 -0.248534552624623 0.0735561884191842 0.211562113832508 3.498671954279 -1.17475926158209 0.00132574782267232 0.248253232989871 0.0808706171830112 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Megasphaera micronuciformis (SP91) 0.566377452739801 -0.973120264415893 0.0672765393345457 0.342487733779324 8.41864724823877 -2.84132880812282 1.77625797823586e-10 0.00696734522785905 1.72297023888879e-08 0.257791773430785 TRUE FALSE TRUE TRUE Alloprevotella sp._HMT_308 (SP92) 1.21750929221208 -3.44364287195926 0.0478814550252956 0.140207316666634 25.4275750719955 -24.5610782220952 1.04688659752766e-23 3.20738166375802e-23 1.476110102514e-21 4.87522012891219e-21 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus sanguinis (SP94) -0.909255085966868 2.16919469872358 0.0804274430891718 0.206657970535911 -11.3052840055944 10.4965450550897 7.13671821039236e-15 8.52059000456483e-14 8.06449157774337e-13 1.07359434057517e-11 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus downii (SP96) 1.45503583777781 -2.6912681805739 0.0564772426918361 0.292653215099681 25.7632237061768 -9.19609982640108 3.5460682664223e-28 8.29735534445372e-12 5.31910239963345e-26 9.29303798578816e-10 TRUE TRUE TRUE TRUE Lachnoanaerobaculum gingivalis (SP98) 0.330087821333986 -0.41417850665361 0.0634232862702859 0.164117625402661 5.20452093774008 -2.52366865312258 5.7958899214469e-06 0.0155835434634759 0.000457875303794305 0.514256934294703 TRUE FALSE TRUE TRUE Prevotella jejuni_nov_97.755% (SPN122) 0.164447446251253 -1.42491066125912 0.0354051341915038 0.1559725860996 4.64473444336542 -9.13564810901583 0.00560868222297278 0.000263275225213992 0.280434111148639 0.0136903117111276 FALSE TRUE FALSE FALSE Actinomyces sp._HMT_175_nov_97.746% (SPN135) 0.131885598525827 -0.277947078412293 0.120631787719036 0.216600882742187 1.09329059130752 -1.28322227912212 0.285585239998204 0.21219403177552 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Haemophilus haemolyticus_nov_97.947% (SPN147) -0.410960634591148 1.93290157146067 0.199104061439412 0.255630525853927 -2.06404948055871 7.56130968711138 0.0491250830992186 5.00866926716978e-08 1 4.15719549175091e-06 FALSE TRUE TRUE TRUE Alloprevotella sp._HMT_473_nov_97.546% (SPN54) 0.0555370686741656 -1.47687520549619 0.187541438664899 0.24368957178567 0.296132252527932 -6.06047765882707 0.7696764051594 2.93701785926645e-06 1 0.000193843178711586 FALSE TRUE FALSE TRUE Campylobacter concisus_nov_97.831% (SPN65) -1.85396286412115 2.89639950248592 0.0446879988334512 0.327170275136059 -41.4868177702639 8.85288096934051 7.42352065875308e-24 5.01904890484194e-09 1.06156345420169e-21 4.56733450340617e-07 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus sanguinis_nov_97.782% (SPN77) -0.963305973552694 2.23484165722654 0.114569438876408 0.265054602846101 -8.40805351758648 8.43162742027216 8.84816592708229e-11 8.18353154854547e-11 8.75968426781147e-09 8.34720217951638e-09 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus parasanguinis_clade_411_nov_97.976% (SPN88) 0.477304418504917 -1.37086713034984 0.291839208183787 0.346975244268867 1.63550477495927 -3.95090760217916 0.111447528078641 0.000386684821368997 1 0.0193342410684499 FALSE TRUE FALSE TRUE Prevotella sp._HMT_305_nov_93.865% (SPN99) 0.00150987299789842 0.132322866595247 0.0552599231968182 0.169646691239204 0.0273231106840438 0.779990848207407 0.978366592815592 0.440955075391128 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Fusobacterium nucleatum_nucleatum_subsp._animalis (SPP1) -0.121986700190172 0.525708277131852 0.0368067217680627 0.155874538641567 -3.31425061321327 3.37263726143701 0.00782299286286986 0.00708988968887452 0.383326650280623 0.257791773430785 FALSE FALSE FALSE FALSE Haemophilus seminalis_sp._HMT_908 (SPP14) -0.219739809138549 0.746236358297901 0.034986803818554 0.16127098952923 -6.28064827750907 4.62722006280395 9.13447327320868e-05 0.000940157778398896 0.00648547602397816 0.0395538999035983 TRUE TRUE FALSE FALSE Streptococcus infantis_infantis_clade_638 (SPP17) 1.56567857363314 -2.78067262047643 0.0466461958822339 0.151018086189299 33.5649787516641 -18.4128450481812 5.36338034915911e-34 7.44029835809766e-23 8.15233813072185e-32 1.12348505207275e-20 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus infantis_infantis_clade_431_infantis_clade_638 (SPP18) 0.108522112601663 -0.83021301751175 0.164994911133727 0.227647338866526 0.657730058799857 -3.64692608156742 0.516280452384758 0.00111735877678545 1 0.0446943510714179 FALSE TRUE FALSE TRUE Veillonella dispar_parvula (SPP2) -0.991016201895543 2.33271693058094 0.0564655038228827 0.180108625634641 -17.5508254562662 12.9517224528322 5.15881760181271e-22 5.94428408635745e-17 6.91281558642903e-20 8.44088340262758e-15 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus parasanguinis_parasanguinis_clade_721 (SPP24) -0.710652903727329 1.77199033424451 0.0507937258308659 0.161742339598032 -13.9909583733565 10.9556368397312 3.45191839776691e-18 2.06361415922747e-14 4.28037881323097e-16 2.72397069018026e-12 TRUE TRUE TRUE TRUE Staphylococcus argenteus_aureus_roterodami (SPP26) -1.66954635857623 2.17217785342606 0.0312347137028339 0.209291321901133 -53.4516299544232 10.378728719828 1.21060729682164e-14 5.0928706131457e-07 1.35588017244024e-12 3.71779554759636e-05 TRUE TRUE TRUE TRUE Lachnoanaerobaculum gingivalis_umeaense (SPP27) 0.27692600625299 -0.753634758928799 0.0890495339839504 0.186288068172525 3.10979736629392 -4.04553424340009 0.00493170806419344 0.000502370460675223 0.251517111273865 0.0238638930215114 FALSE TRUE TRUE TRUE Veillonella denticariosi_dispar_parvula (SPP3) 0.573009667870927 -0.795334808952004 0.0820785277634384 0.164397706831668 6.9812371576939 -4.83787045622461 9.7222372917867e-09 1.5114004562164e-05 9.04168068136163e-07 0.000937068282854171 TRUE TRUE TRUE TRUE Streptococcus multispecies_sppn1_2_nov_97.976% (SPPN1) 1.17292720256039 -2.39807779522765 0.174778011456599 0.241173990317061 6.71095404270376 -9.94335165278395 4.74791824603391e-08 2.27453049187943e-12 4.22564723897018e-06 2.63845537058014e-10 TRUE TRUE TRUE TRUE Parvimonas multispecies_sppn9_2_nov_96.842% (SPPN9) -1.05768812264171 3.30952639168534 0.121054611059382 0.184917609522231 -8.73728074780131 17.8973024810136 3.28434606746299e-10 7.06633441626673e-19 3.15297222476447e-08 1.02461849035868e-16 TRUE TRUE FALSE FALSE