taxon lfc_(Intercept) lfc_Comparison3Healthy se_(Intercept) se_Comparison3Healthy W_(Intercept) W_Comparison3Healthy p_(Intercept) p_Comparison3Healthy q_(Intercept) q_Comparison3Healthy diff_(Intercept) diff_Comparison3Healthy passed_ss_(Intercept) passed_ss_Comparison3Healthy Selenomonas -0.477149668118867 1.09987037534838 0.221122416092829 0.603285798462119 -2.15785299631746 1.82313321174166 0.0475612570539712 0.0882735210557312 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Leptotrichia -0.0240601800857643 0.356145391760988 0.219902792616176 0.366765756083153 -0.109412799171494 0.97104319542919 0.913913883439304 0.342579258663852 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-3] -0.262841202741628 0.333765266051976 0.215719426586232 0.35474219884479 -1.21844011409218 0.94086710613757 0.248544297568668 0.366976031956859 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Johnsonella 0.282443518865103 -1.18761906066093 0.0700111235217386 0.291688834387187 4.03426633736858 -4.07152732862063 0.0563037028527323 0.0553614815794228 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Alloprevotella 0.097495366578339 0.0455034391749461 0.392166630251832 0.639195382374567 0.248606992685053 0.0711886231184961 0.806079915648796 0.94392125240033 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnospiraceae_[G-3] -0.0588182667399597 0.115369475085724 0.222691999137803 0.473214395009351 -0.264123843549326 0.24379958915545 0.794859755027358 0.810303881595275 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] -0.271050718464165 0.987343434283567 0.308084528129508 0.57320868100469 -0.879793347980866 1.72248513848919 0.388928480052435 0.099678524659211 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Megasphaera -0.484908085429826 1.34808889732434 0.146280354654884 0.319197617885935 -3.3149228177212 4.22336766249327 0.0802064582074853 0.051750316865531 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptoanaerobacter -0.352803785876373 -0.00876900187368759 0.1063582340727 0.291943199283169 -3.31712715007301 -0.0300366711580157 0.029457484522894 0.977476729868508 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Catonella -0.405680140466932 0.928559371135808 0.166439996325127 0.309386097881903 -2.4373957547708 3.00129636558606 0.0299128060565877 0.0102134041060402 1 0.694511479210735 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella 0.0081040175679952 0.273947997756936 0.270059643271384 0.558737113910423 0.0300082510286494 0.490298551745849 0.976343840306497 0.629006266655035 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Stomatobaculum -0.0596283974542901 0.0621605466472067 0.135963039759734 0.343486750570928 -0.438563285725752 0.180969270412574 0.67131683543161 0.860401434308731 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Aggregatibacter 0.217120168285583 -0.316411140449061 0.282168874416214 0.426034259086881 0.76946888183464 -0.742689428608923 0.450607818223673 0.466304159150367 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnoanaerobaculum 0.201689755444095 -0.259972465283652 0.151784733616043 0.444569730567974 1.3287881504229 -0.584773202960796 0.200517930681487 0.565958863006322 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Pseudoleptotrichia -0.22559613646745 0.827754477642084 0.231142266286388 0.476914349587526 -0.976005557494769 1.7356459883373 0.343588479653161 0.101841209539822 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Arachnia 0.0411037272979107 0.113851270854138 0.257364245157524 0.550111689496418 0.159710325234776 0.206960282844306 0.874711207080197 0.83813344537099 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptidiphaga -0.382688294716102 1.0042903030507 0.514471752221 0.685457702198353 -0.743847049063468 1.46513825700669 0.466568843017618 0.160132593683068 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] 0.112671328735384 -0.175103907648243 0.257125279941776 0.42349705553639 0.438196231661461 -0.413471369774841 0.666457569210195 0.684145626815662 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Streptococcus 0.00567563980904035 0.280153852029822 0.253741156173012 0.393719787304511 0.0223678330099925 0.71155644461716 0.982365716752439 0.484569475409421 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Ruminococcaceae_[G-1] -0.2319106136425 0.376386226196792 0.26393670715317 0.44075960185065 -0.878659948985102 0.853949011244296 0.393443465069836 0.406564670791351 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Dialister -0.418001784836491 0.647707488149728 0.0321350125868697 0.33242125470886 -13.0076745327707 1.94845389389136 0.000981087611167922 0.146495025333488 0.0667139575594187 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Lancefieldella 0.352549847954555 -0.199051938428581 0.191133004730232 0.410326397401448 1.84452626825048 -0.485106343850055 0.102332498337157 0.640605747268625 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Kingella -0.000992906883076762 0.366334834011405 0.271775302320491 0.487796784615372 -0.00365341101490479 0.750998869950036 0.997121202246718 0.461399029003281 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-1] -0.16303874406185 0.331735550994298 0.087394579061837 0.2833724474041 -1.86554756384249 1.17066974588828 0.121104343304872 0.294484556941269 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Bacteroidales_[G-2] -0.538250424771974 0.674570075183309 0.16152181901853 0.370214680950595 -3.33236975686997 1.82210514572579 0.0125502258337651 0.111224932503208 0.7906642275272 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Butyrivibrio NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Campylobacter -0.247725470273948 0.746730076440072 0.184485671254168 0.52169328475994 -1.34278976025544 1.4313584212296 0.195163039188015 0.168571636351686 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Solobacterium -0.0398858350033739 0.0993385242705799 0.218407590623689 0.430095144659541 -0.182621102542614 0.230968718210514 0.858144261796138 0.821230151351733 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Ruminococcaceae_[G-2] -0.253855095287221 0.477860296259664 0.238275923300124 0.425954130007836 -1.06538290470697 1.12185858193433 0.307670033096582 0.283869522415466 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lautropia 0.229387251994275 -0.291553601332447 0.214980973989268 0.48222193640332 1.06701187429603 -0.604604600750882 0.298080189932989 0.551919027833836 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Rothia 0.0968190547478824 0.0472317916305582 0.365490782224093 0.533631507229949 0.264901495350216 0.0885101254154496 0.793668103595847 0.930309892237729 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-8] -0.880844883966613 1.46275166669105 0.15028438690396 0.31592258058135 -5.86118692775134 4.63009533538042 0.0278967735157444 0.0436173901878065 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-7] 0.0438112193978784 -0.427597764465356 0.180148272393854 0.370016422666401 0.243195334685725 -1.15561834089421 0.812770036233535 0.274701635264984 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Gracilibacteria_(GN02)_[G-1] 0.220094015776433 -0.4293733461081 0.273933670487295 0.468724124535852 0.80345733105723 -0.916047038400854 0.432193157700345 0.371752440372326 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Schaalia -0.0702946892567335 0.474300248531242 0.245564267999872 0.484519625725893 -0.286257808716576 0.978908228579306 0.777485624068646 0.338768782982633 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Treponema -0.799410549068962 1.3864052230321 0.16562979817088 0.360067199519682 -4.82648990638878 3.85040688205291 0.000938470793727643 0.00390388569051008 0.0647544847672074 0.273271998335706 FALSE FALSE FALSE FALSE Cloacibacterium -0.727910764163326 1.85434856133188 0.140821268482782 0.330755515708542 -5.16903996112155 5.60640253378546 0.00355773493673477 0.00249560499723918 0.23836824076123 0.177187954803982 FALSE FALSE FALSE FALSE Ottowia 0.0479582473142307 -0.495101566101035 0.169831350122065 0.332271843213222 0.282387481932876 -1.49004971746379 0.784814616831441 0.174542693345282 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Olsenella -0.4058445528203 0.159265653314268 0.0304855022704302 0.285840977742631 -13.3127067817398 0.557182719468827 0.0477308226135868 0.676380040109385 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-9] -0.465181859828795 0.659415712501109 0.132143792527255 0.292185084811913 -3.52027023693035 2.2568424836798 0.00784280169928625 0.0539877416116024 0.509782110453606 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Corynebacterium 0.0207561570070587 0.241614752523773 0.291081556467952 0.503060314175195 0.0713070153221612 0.4802898295007 0.943828154411945 0.635986526428675 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Haemophilus -0.00529711308480591 0.308195331647426 0.257141090413817 0.473135247276614 -0.020600025753493 0.651389498925331 0.983759199810595 0.521860325089107 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Propionibacteriaceae_[G-1] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Porphyromonas 0.149825427842391 -0.0882289396109655 0.244379088669803 0.474242950328051 0.613086122294327 -0.186041647113435 0.546402669374858 0.854197464407049 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Gracilibacteria_(GN02)_[G-2] -1.21597554499463 1.43763633115481 0.0304855022704302 0.399119644922807 -39.8870103634172 3.60201846599874 0.000627953958730004 0.0691724411676326 0.0439567771111002 1 TRUE FALSE FALSE FALSE Gemella 0.104019659657473 0.0288302457504909 0.219083675809512 0.382837326609999 0.474794204876842 0.0753067784841698 0.639834130845273 0.940683423619313 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcus -0.045494097610393 0.280729980386514 0.184589642703227 0.37694858109363 -0.246460727395935 0.744743433101778 0.8086665596313 0.467935484424145 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Fusobacterium 0.160721414104719 -0.116074237836915 0.263168577585472 0.40543119908563 0.610716581665302 -0.286298237774245 0.547940858446951 0.777455084846393 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Neisseria 0.0533203861061992 0.15839505593708 0.220386801433649 0.56669922760869 0.241940015279237 0.279504626476134 0.811173624961213 0.782591969121033 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Abiotrophia 0.418478695198133 -0.774787289520084 0.242897492731121 0.49876295560894 1.72286132101567 -1.55341787277314 0.0996092280370588 0.135265171409378 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Tannerella -0.225181585105205 0.516364264674889 0.183973707450392 0.426376829763776 -1.22398786340665 1.21105141890794 0.239834979292934 0.244611372355464 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Granulicatella 0.0814458013255537 0.0865189948209517 0.225976710004763 0.38164204990569 0.360416793942336 0.226701944511439 0.72213531161641 0.822847727461059 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Eikenella 0.218510804883577 -0.376585256930152 0.157569799643719 0.318392136115222 1.38675561800327 -1.18277185336597 0.182452143302901 0.252287552667348 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Weeksellaceae_[G-1] -0.12493194360275 0.324729451817894 0.216195080798822 0.369079419455148 -0.577866726389597 0.879836248516036 0.570929856616094 0.391216190550685 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptococcus 0.169315960678023 -1.17024475526612 0.206729058081373 0.344793151515368 0.819023519235385 -3.39404872203201 0.431858585773975 0.00683913156054739 1 0.47190007767777 FALSE FALSE TRUE FALSE Riemerella 0.058711397199017 0.144618027588768 0.223456475397403 0.457298415151383 0.262741981831596 0.316244322738127 0.795309903759719 0.75493897110779 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Actinomyces 0.0837928867013654 0.0805208877494329 0.211127430325722 0.38212156511899 0.396882994180775 0.210720605952609 0.695458370891058 0.835136570991013 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Cardiobacterium 0.060538934741385 0.0135304330122623 0.254840687660333 0.398474168336845 0.237556001348085 0.0339556088886158 0.814768287480717 0.973266736867728 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Mogibacterium -0.0811476506758238 0.152423931731329 0.157203773708886 0.392183525948208 -0.51619403759413 0.388654600834658 0.615936517096176 0.704948950876072 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] 0.354441103276032 -1.02960922582525 0.343864072941317 0.523771030893912 1.03075933535086 -1.96576206986483 0.320133024966846 0.0694809566182598 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Capnocytophaga -0.0835098711249543 0.50807237997225 0.310166663758964 0.436891003261242 -0.26924192984792 1.16292708291007 0.790371200850791 0.257904161827602 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Simonsiella 0.00684766829927429 0.830896280996214 0.0824048834965831 0.287057534046693 0.0830978457673353 2.89452873534774 0.939007884187461 0.0627810576862719 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnospiraceae_[G-2] 0.159564846826048 -0.873211798377763 0.265728076396614 0.524460266987384 0.600481699148301 -1.66497226452193 0.56299885655421 0.13027389951022 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Streptobacillus 0.266433188852547 -0.390282572411322 0.0764716647113929 0.391367236755472 3.48407727042528 -0.997228525430125 0.0130773563347988 0.357156264541289 0.810796092757524 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Moraxella -0.0314806679674601 -0.356965537788642 0.281851655493909 0.397808852284817 -0.111692329471311 -0.897329297069205 0.918121158194728 0.435669784600153 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lacrimispora -1.29594716774882 1.80274746444943 0.1336986188527 0.450123132050365 -9.69304828179723 4.00500959867959 0.000198476778626113 0.0102722264910471 0.014091851282454 0.694511479210735 TRUE FALSE FALSE FALSE Pullulanibacillus -0.353276787509724 1.04486219718409 0.063770971200652 0.290309039352793 -5.53977430260795 3.59913766210475 0.00519127401627652 0.0227756186825759 0.34262408507425 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Centipeda -0.367795739467335 -0.187858626093701 0.0349813050930454 0.285834747505665 -10.5140656842004 -0.657228093270842 0.008925118050947 0.578556938289757 0.571207555260608 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Veillonella 0.0460057789254233 0.177087940954618 0.275560852415451 0.454477097703806 0.166953246523067 0.389652067946515 0.869003999222154 0.70071746327072 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Oribacterium -0.424589062709065 0.730830654523934 0.171417667061769 0.452194767677871 -2.47692708684495 1.61618556153784 0.0307410193027394 0.134347027120104 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Parvimonas -0.0744454882280945 -0.0495747130509523 0.179954857774159 0.314956039674701 -0.413689795034723 -0.157402007918803 0.686398864814498 0.877545474683026 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE