#Species F9928.S01 F9928.S02 F9928.S03 F9928.S04 F9928.S05 F9928.S06 F9928.S07 F9928.S08 F9928.S09 F9928.S10 F9928.S11 F9928.S12 F9928.S13 F9928.S14 F9928.S15 F9928.S16 F9928.S17 F9928.S18 F9928.S19 F9928.S20 F9928.S21 F9928.S22 F9928.S23 F9928.S24 F9928.S25 F9928.S26 F9928.S27 F9928.S28 F9928.S29 F9928.S30 F9928.S31 F9928.S32 F9928.S33 F9928.S34 F9928.S35 F9928.S36 F9928.S37 F9928.S38 F9928.S39 F9928.S40 F9928.S41 F9928.S42 F9928.S43 F9928.S44 F9928.S45 F9928.S46 F9928.S47 F9928.S48 F9928.S49 F9928.S50 F9928.S51 F9928.S52 F9928.S53 F9928.S54 F9928.S55 F9928.S56 F9928.S57 F9928.S58 F9928.S59 F9928.S60 F9928.S61 F9928.S62 F9928.S63 Enterococcus faecalis (SP1) 10670 7152 184 4926 1586 2043 2239 3690 11378 17544 4236 7182 1876 18511 20386 12 7123 9829 462 5091 7866 2271 1148 2909 4150 20633 3035 316 3154 6999 3410 11118 17335 3768 12251 24346 431 58 344 541 2635 858 796 440 543 991 2393 2388 1693 779 1577 2235 399 518 655 829 1655 1229 944 697 456 371 271 Staphylococcus hominis (SP10) 362 209 147 191 109 155 159 123 382 550 295 401 279 561 590 306 361 344 166 261 284 131 453 184 235 579 145 194 143 212 149 319 499 284 444 660 277 27 394 70 1080 200 272 1 458 331 358 330 480 254 917 1199 175 118 169 278 867 266 280 317 134 60 209 Fusobacterium canifelinum (SP100) 27 15 200 24 8 56 4 16 65 26 25 19 3 38 42 0 11 35 0 13 13 9 0 25 6 39 0 14 10 27 6 23 23 8 22 47 0 0 7 2 10 0 0 0 108 0 21 109 18 1 51 80 7 36 4 1 42 89 49 48 8 11 7 Klebsiella aerogenes (SP101) 41 26 0 9 5 10 6 12 29 38 8 26 3 54 53 0 15 30 0 14 28 5 0 6 10 69 10 1 15 11 9 39 60 9 25 74 85 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 8 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87 172 33 Bifidobacterium breve (SP102) 35 30 0 27 4 1 8 14 24 49 4 22 1 56 47 0 25 30 0 19 26 12 42 2 10 74 8 0 12 25 15 21 50 14 45 70 0 0 9 4 102 12 0 0 6 25 7 12 36 33 58 67 4 0 21 32 59 0 23 12 13 2 8 Glutamicibacter protophormiae (SP103) 14 13 0 6 0 1 1 5 15 19 4 8 3 19 30 179 7 17 0 5 7 2 9 2 6 24 4 0 2 7 3 15 19 7 8 27 62 0 12 3 10 0 26 0 1 0 0 11 12 1 62 98 3 0 0 6 45 0 4 13 13 0 3 Veillonella sp. HMT780 (SP104) 31 18 0 17 18 8 11 10 41 52 3 25 215 63 48 0 26 34 1 17 23 35 5 1 12 54 11 1 6 26 14 27 62 18 40 77 80 0 0 15 0 0 164 0 0 0 5 6 145 0 0 17 133 12 20 0 0 0 0 0 0 3 0 Parasutterella excrementihominis (SP105) 47 29 1 23 6 11 5 16 36 59 10 31 4 76 55 0 25 34 1 25 36 13 39 8 11 84 11 1 22 25 6 48 54 15 52 72 0 0 12 9 64 15 0 0 9 40 8 14 36 38 68 87 6 0 7 23 62 0 7 9 9 5 5 Corynebacterium coyleae (SP106) 63 83 119 18 1 3 21 27 26 28 26 20 0 39 28 0 165 38 6 73 33 26 110 61 5 36 2 14 20 15 40 17 65 245 98 24 0 0 40 19 291 49 0 0 17 83 2 29 155 93 381 453 19 0 46 87 253 19 52 61 47 16 28 Bradyrhizobium frederickii (SP107) 1 0 0 5 0 1 0 1 1 0 0 4 0 2 3 0 3 3 0 2 3 12 0 1 0 13 3 1 6 2 23 4 19 87 29 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Glutamicibacter soli (SP108) 58 62 0 30 10 7 11 31 78 112 17 30 10 103 92 0 57 85 0 49 57 22 0 26 26 128 27 5 26 59 40 84 117 171 113 125 0 0 30 32 27 0 0 422 9 0 15 10 85 56 201 283 11 0 37 33 139 0 11 26 31 28 11 Tepidiphilus succinatimandens (SP109) 64 34 2 49 7 12 11 32 68 99 20 28 1 131 101 0 34 64 121 66 31 20 54 21 109 122 19 7 24 53 55 53 150 254 117 120 0 0 7 6 87 12 0 0 3 32 16 16 28 12 72 77 6 30 31 25 55 125 66 59 23 9 16 Staphylococcus aureus (SP11) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 73 2 0 1 0 0 1 0 0 5 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50 0 0 10 0 0 74 0 0 0 0 0 6 0 0 6 0 0 7 0 0 0 0 0 0 0 0 Cutibacterium avidum (SP110) 78 67 153 46 16 62 19 40 121 132 203 67 11 151 129 0 105 92 295 108 68 17 81 110 222 159 18 12 36 70 49 99 150 201 137 158 0 0 30 15 224 35 0 6 9 72 18 24 110 70 228 263 16 0 28 56 175 0 32 47 29 16 11 Corynebacterium matruchotii (SP111) 96 59 3 48 23 39 20 29 104 132 15 44 112 160 160 1 51 60 3 58 72 26 100 17 37 155 26 3 30 63 29 85 142 26 101 180 34 0 24 28 178 22 67 0 12 50 27 29 82 60 180 245 20 26 51 44 180 107 52 90 23 23 18 Hathewaya histolytica (SP112) 0 0 0 3 0 1 0 3 9 0 0 0 113 1 0 0 4 9 3 0 0 3 4 3 0 13 0 3 3 0 20 12 20 156 44 0 49 0 0 8 0 0 88 0 0 0 0 0 8 0 0 11 3 27 15 0 19 123 22 33 5 4 15 Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] bacterium HMT870 (SP113) 32 24 2 26 7 3 6 9 50 69 10 30 3 82 78 0 27 30 0 10 25 13 0 10 12 72 14 0 13 20 20 34 84 10 34 75 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 2 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Neisseria mucosa (SP114) 38 18 18 13 6 18 76 17 36 43 5 19 340 41 38 5 13 39 6 63 17 21 24 17 4 54 54 63 65 53 18 22 57 8 34 62 99 0 42 25 0 0 215 0 159 0 161 23 35 0 32 39 40 5 120 7 81 0 0 15 0 32 14 Capnocytophaga sputigena (SP115) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 149 20 0 0 0 0 45 29 0 0 0 0 0 68 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Shigella sonnei (SP116) 14 13 0 12 1 1 2 5 15 23 4 11 1 25 32 0 9 18 0 8 9 8 0 3 12 27 9 1 8 5 7 7 31 8 11 32 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 1 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Escherichia coli (SP117) 16 69 32 9 67 29 18 10 38 23 2 18 1 18 25 0 7 18 0 6 20 36 0 4 0 19 4 178 18 7 4 12 21 6 19 26 0 0 0 10 9 0 0 253 0 0 2 2 15 29 0 0 0 37 10 0 7 102 49 38 5 17 14 Corynebacterium mastitidis (SP118) 38 27 99 25 11 34 17 26 67 55 24 26 4 55 43 0 33 47 0 13 20 14 45 11 68 60 13 5 9 33 103 53 49 9 85 104 0 0 2 0 78 15 0 0 6 28 13 15 20 24 0 0 2 0 16 19 13 0 6 1 2 0 5 Leptothrix sp. HMT025 (SP121) 9 2 17 6 6 4 39 7 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 4 0 0 0 0 0 18 50 37 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 17 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Faecalicatena fissicatena (SP122) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 147 0 0 0 0 0 5 0 0 1 47 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 41 0 1 11 85 27 84 0 2 36 0 0 24 24 2 8 7 0 18 30 19 0 12 2 4 0 6 Anaerostipes caccae (SP123) 15 5 1 2 2 6 4 0 14 12 2 5 1 5 27 0 7 7 0 3 1 7 0 4 6 26 2 0 3 4 8 10 11 3 7 38 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 3 2 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Bacteroides thetaiotaomicron (SP124) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 76 1 0 0 0 0 129 27 0 3 3 0 74 0 0 0 0 0 3 0 0 4 0 0 43 0 0 12 0 0 77 0 0 0 0 0 14 0 0 6 0 0 9 0 0 0 0 0 0 4 0 Corynebacterium propinquum (SP125) 32 8 0 9 4 2 3 3 17 30 132 21 2 27 43 0 37 52 0 11 18 6 0 71 10 42 9 1 5 10 9 25 27 11 20 49 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 4 10 4 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Enterobacter hormaechei (SP14) 247 233 585 237 256 209 84 138 389 344 706 284 330 404 374 2 433 341 126 221 226 105 91 421 198 412 76 384 120 203 236 246 481 336 381 451 134 0 70 44 215 43 234 4 73 75 106 73 243 72 334 468 55 88 127 78 304 227 219 188 114 73 52 Bradyrhizobium valentinum (SP15) 155 119 198 78 31 78 104 67 196 255 52 111 14 264 327 0 111 143 130 123 115 52 216 33 155 264 97 85 88 143 54 162 239 52 177 353 0 0 32 46 457 279 0 573 18 184 25 67 108 168 217 380 37 0 76 243 230 1 53 45 54 14 17 Ligilactobacillus murinus (SP16) 2015 1523 477 1030 567 576 632 797 2260 3327 2232 1528 1600 3392 3664 516 1852 2272 623 1242 1557 661 697 1326 1102 3786 779 598 812 1594 771 2081 3257 1389 2420 4466 752 51 412 332 1661 799 1124 498 540 714 755 825 868 460 1127 1481 299 456 740 712 1185 1301 726 602 263 278 358 Janibacter cremeus (SP17) 136 104 0 42 80 17 29 46 142 165 27 84 127 216 232 1 71 96 14 60 95 59 210 15 42 227 46 129 66 65 45 121 176 26 110 251 47 0 14 30 405 71 80 211 1 147 18 30 121 111 74 75 28 0 86 78 109 0 36 27 32 0 9 Staphylococcus caprae (SP18) 830 532 244 426 171 244 217 319 802 1191 363 499 884 1342 1267 297 512 729 381 488 544 220 272 250 612 1380 249 39 234 532 460 773 1169 727 991 1665 516 13 109 136 545 119 602 234 59 159 163 176 437 232 774 1145 73 265 224 197 629 693 388 308 134 176 152 Klebsiella pneumoniae (SP19) 2200 1719 601 1115 697 549 666 892 2452 3384 1688 1562 1030 3549 3865 1481 1722 2170 406 1321 1568 780 1670 998 1212 4049 815 995 997 1589 1075 2185 3338 1706 2657 4706 963 28 630 444 3503 853 862 1204 792 1194 939 860 1382 1087 2324 3170 418 522 998 1109 2380 1251 947 815 447 291 428 Streptococcus danieliae (SP2) 608 447 281 298 162 220 115 230 704 920 1219 557 1139 963 1051 142 865 701 780 570 458 217 496 730 728 1110 179 228 203 399 304 623 903 733 745 1272 428 332 175 214 1060 486 794 856 275 456 318 264 568 379 872 1204 155 172 271 397 828 379 324 251 204 624 110 Varibaculum cambriense (SP20) 209 90 295 127 49 76 119 91 192 176 402 146 118 248 226 120 205 198 162 116 95 62 337 184 166 255 62 64 60 107 142 155 272 614 275 273 112 298 105 55 956 359 126 258 279 235 272 159 235 245 395 537 138 88 145 277 576 267 190 164 85 44 56 Staphylococcus capitis (SP21) 1419 1250 816 797 506 521 353 686 1742 2158 1882 1131 809 2327 2460 170 1463 1590 162 856 974 471 736 1149 829 2691 425 695 620 1050 955 1371 2286 1532 1977 3066 378 0 496 221 1569 761 526 921 369 523 671 416 704 562 1105 1574 284 454 592 701 1182 1190 722 533 234 483 377 Corynebacterium tuberculostearicum (SP22) 259 181 7 128 51 42 57 78 278 424 499 200 17 421 439 0 204 355 5 125 187 77 326 239 83 447 65 9 111 168 101 298 395 81 278 545 0 27 54 40 872 147 0 359 256 226 93 280 197 217 242 238 65 194 252 208 298 525 297 211 77 78 82 Fusobacterium nucleatum (SP23) 911 668 25 407 154 167 291 312 908 1473 670 630 373 1422 1539 0 813 881 139 513 648 251 456 462 461 1615 306 95 305 563 418 904 1429 741 1070 1761 116 0 156 112 913 889 207 512 152 320 283 204 562 343 1025 1511 136 201 170 621 938 589 405 459 182 80 119 Facklamia languida (SP24) 149 120 5 83 30 39 44 57 186 299 32 141 164 353 353 172 117 161 472 197 131 59 109 29 425 338 64 6 61 139 69 192 315 101 224 423 141 13 64 52 217 45 131 296 102 101 124 58 140 132 238 330 30 11 43 43 263 0 46 53 38 15 19 Citrobacter murliniae (SP25) 29 15 18 23 22 13 55 14 25 57 4 13 2 60 70 0 14 26 0 29 29 3 38 15 14 59 54 71 56 28 9 26 64 7 32 67 0 0 2 0 63 17 0 0 0 22 5 6 21 13 3 0 12 0 17 18 13 0 12 0 3 0 3 Rothia mucilaginosa (SP26) 176 108 275 125 30 108 40 86 265 243 483 180 95 262 328 206 421 278 135 212 183 70 98 324 152 332 58 32 86 165 120 180 285 314 260 417 108 34 62 38 571 88 144 299 36 55 34 142 108 78 425 580 30 123 155 125 340 362 180 186 75 59 54 Actinomyces sp. HMT448 (SP27) 72 42 221 43 13 64 18 43 115 79 475 94 116 92 80 0 254 143 7 64 37 18 113 233 71 102 26 18 15 54 148 63 74 135 134 141 32 0 56 23 261 39 71 10 17 97 9 28 127 77 248 389 32 0 38 109 186 4 42 36 56 237 26 Pantoea allii (SP28) 35 15 0 11 4 3 5 9 29 33 190 40 2 42 42 0 216 65 8 68 52 4 159 134 3 51 16 0 9 20 5 29 43 9 21 55 0 0 70 31 361 63 0 492 288 140 212 41 80 180 152 105 97 21 71 89 283 0 41 27 24 3 11 Neisseria sicca (SP29) 13 21 25 11 36 38 12 10 20 0 30 0 81 2 0 0 132 9 0 29 35 1 46 47 0 0 0 59 0 0 2 0 0 0 0 0 48 0 9 15 78 9 75 0 6 24 0 3 41 27 49 120 5 38 42 23 59 136 53 49 14 6 21 Streptococcus parasanguinis_clade_411 (SP3) 80 70 0 38 20 22 25 38 101 123 351 95 14 170 152 123 273 138 4 99 87 32 73 162 28 171 35 12 40 114 32 96 155 33 124 200 79 10 76 20 198 26 28 0 312 80 213 175 123 69 334 475 82 3 86 85 366 3 37 59 37 43 19 Streptococcus sp. HMT066 (SP30) 128 115 100 46 24 25 62 77 200 176 634 143 12 233 197 0 228 200 1 50 91 32 75 314 27 184 41 14 64 86 79 94 192 31 160 256 0 0 111 47 247 175 0 244 153 72 153 59 172 113 412 509 63 84 26 192 372 189 112 156 83 34 41 Methylophilus leisingeri (SP31) 61 43 0 29 15 18 12 18 54 105 16 23 4 83 112 0 27 45 164 65 35 17 162 12 148 82 25 0 16 27 24 57 88 20 60 122 0 0 36 19 288 195 0 226 77 151 65 28 78 90 143 212 39 62 59 151 189 101 80 68 29 15 45 Neisseriaceae_[G-1] bacterium HMT174 (SP32) 33 26 7 17 10 17 65 22 29 61 584 77 207 69 54 131 272 108 10 63 43 33 105 301 59 58 43 49 57 15 117 48 62 14 70 120 134 20 48 58 312 225 142 17 8 58 10 72 174 76 403 629 23 43 76 166 355 105 82 116 68 34 29 Cutibacterium acnes (SP33) 1039 662 19 479 176 181 278 320 1057 1582 787 690 883 1705 1737 3 852 1033 12 509 782 234 576 477 466 1846 354 80 346 693 595 1089 1573 641 1285 2259 292 42 296 143 1504 273 555 2 30 348 199 350 548 318 784 1133 99 207 323 342 838 623 418 325 152 77 233 Weizmannia ginsengihumi (SP34) 29 19 1 15 4 7 2 10 38 30 172 25 121 53 56 3 41 38 4 10 15 17 107 82 9 31 5 0 5 18 11 30 27 8 30 71 61 0 21 23 225 31 93 0 169 75 29 112 63 53 85 128 27 41 58 61 104 131 72 71 26 12 16 Bradyrhizobium lupini (SP35) 219 160 174 126 46 74 52 99 256 327 576 186 391 377 296 158 196 291 301 178 147 85 90 282 388 396 95 24 96 169 234 197 345 86 238 474 200 0 30 69 118 32 262 284 6 34 38 42 131 87 206 282 16 30 109 79 171 0 11 38 102 127 29 Enterococcus gallinarum (SP36) 426 292 360 264 75 175 107 184 554 741 1622 484 278 744 817 3 793 615 11 248 367 135 62 740 244 839 124 18 156 302 339 455 778 365 623 993 110 17 81 55 322 49 197 301 579 52 340 499 198 79 390 515 71 282 94 73 443 473 261 261 62 56 89 Acinetobacter lwoffii (SP37) 413 240 122 265 84 161 117 231 538 626 272 333 321 781 859 353 282 410 124 263 320 127 234 137 236 820 138 38 148 308 229 457 659 508 607 875 324 0 135 72 416 274 273 11 487 111 336 330 294 136 675 938 123 120 111 230 636 271 227 231 97 67 91 Enterobacter cloacae (SP38) 51 31 113 40 22 41 15 27 83 94 164 78 103 126 105 1 60 109 8 46 42 19 68 105 19 95 37 13 54 124 17 53 61 16 48 138 27 0 45 41 174 171 53 411 145 167 180 72 136 84 150 172 47 77 162 155 198 96 38 57 47 86 20 Streptococcus mitis (SP4) 412 321 485 211 148 272 113 271 453 588 908 317 526 514 672 289 343 419 488 295 219 161 472 389 423 601 135 209 169 284 133 334 544 294 385 758 369 8 296 121 912 312 413 731 854 486 729 433 413 352 592 709 255 243 274 375 799 466 375 284 147 111 105 Prevotella oralis (SP40) 27 10 13 7 11 18 45 37 13 29 3 9 0 36 20 0 3 10 108 43 19 21 40 0 196 31 22 43 29 14 208 37 20 13 92 69 0 0 1 8 70 12 0 0 0 25 6 11 18 9 1 0 7 27 25 9 26 109 54 36 12 4 7 Corynebacterium durum (SP41) 224 138 0 103 41 42 48 81 193 313 249 144 261 340 422 176 198 212 527 227 118 82 261 118 456 362 62 11 64 149 102 199 337 256 283 429 232 0 64 45 538 95 232 15 118 344 163 102 249 144 186 240 122 70 126 129 270 3 68 36 80 35 27 Bifidobacterium pseudolongum (SP42) 377 236 483 272 61 181 93 233 423 542 410 282 36 527 556 182 299 367 306 221 239 86 164 249 365 567 109 32 112 269 130 355 491 272 406 638 119 0 3 10 301 59 47 0 179 109 87 188 96 74 13 0 23 47 43 62 72 157 106 56 37 5 28 Cutibacterium namnetense (SP43) 103 69 8 56 23 21 22 33 132 196 190 98 155 179 191 1 103 140 179 86 77 24 169 99 131 237 42 5 45 95 49 105 201 69 95 280 44 0 25 24 375 55 78 303 170 112 67 172 136 143 178 271 27 53 72 119 194 166 118 98 40 18 28 Microbacterium maritypicum (SP44) 25 13 0 16 2 6 12 19 19 40 313 40 192 39 38 163 72 50 112 53 25 29 224 132 95 46 17 11 32 42 32 30 44 129 59 69 124 19 36 33 543 85 167 0 90 120 62 65 115 114 102 109 52 0 185 89 155 0 44 21 23 37 12 Corynebacterium ureicelerivorans (SP45) 75 65 167 70 11 55 17 33 120 119 40 53 4 117 128 209 63 59 154 76 47 16 64 17 138 124 29 10 20 67 25 71 124 27 72 134 88 10 275 15 342 50 28 18 128 36 88 68 120 67 352 391 68 0 47 49 270 14 36 61 44 11 164 Corynebacterium aurimucosum (SP46) 156 95 1 80 26 35 43 42 151 220 35 102 419 270 288 189 106 124 16 81 98 51 92 30 149 295 39 10 66 87 177 158 255 222 286 394 223 27 25 56 304 50 328 0 17 53 40 129 89 33 189 232 14 0 69 60 119 0 12 24 26 5 5 Jeotgalicoccus halotolerans (SP47) 130 91 0 119 27 107 40 133 236 218 368 132 132 212 233 0 299 189 147 130 100 46 181 229 155 264 36 28 77 75 110 171 278 421 270 273 40 0 46 36 333 74 75 269 147 204 104 126 187 103 337 487 53 185 88 109 273 428 249 219 98 61 73 Corynebacterium jeikeium (SP48) 244 230 168 97 70 55 70 113 184 275 47 120 165 266 315 0 92 172 1 92 151 76 73 32 68 340 72 93 90 196 48 248 283 59 190 379 59 0 60 30 160 19 111 0 241 35 78 197 164 88 463 610 39 109 63 71 296 365 170 206 54 42 49 Triticum aestivum (SP49) 473 331 202 240 85 141 98 200 498 696 600 365 634 804 829 573 395 464 18 235 331 129 439 323 255 812 136 33 182 345 377 493 702 407 605 1031 595 21 95 115 977 161 568 22 124 331 316 250 424 268 712 891 219 87 266 276 639 174 204 163 121 91 103 Bifidobacterium longum (SP5) 93 143 276 99 74 86 25 45 171 155 255 111 267 158 174 0 122 122 12 53 80 35 148 101 31 170 34 172 43 107 46 87 132 46 127 218 91 0 58 68 360 63 152 602 26 99 32 31 179 202 396 559 36 0 78 114 292 25 49 73 63 32 24 Faecalibaculum rodentium (SP50) 329 175 117 293 54 143 124 203 406 464 87 189 318 476 569 1 174 274 182 182 235 104 245 61 225 563 150 100 146 262 99 277 481 99 332 626 115 256 91 96 666 257 210 404 189 368 347 227 258 166 403 553 150 163 192 253 429 162 149 97 142 269 68 Bacillus subtilis (SP51) 659 443 467 372 152 262 299 274 807 1009 717 482 507 1043 1188 299 568 712 20 330 442 239 487 394 282 1179 294 198 357 541 367 747 1027 345 778 1393 368 236 205 216 1339 434 398 1739 283 471 381 387 528 645 831 1137 262 388 328 368 887 1067 657 593 312 161 218 Corynebacterium afermentans (SP52) 95 70 0 47 11 12 23 29 106 164 754 146 404 161 183 2 185 178 13 44 50 26 102 277 43 178 28 1 23 71 43 115 127 38 95 205 143 0 28 63 211 50 218 260 6 72 9 32 119 110 181 192 39 39 82 47 139 134 81 61 25 19 18 Salmonella enterica (SP53) 95 70 1 52 28 23 35 35 144 197 43 79 228 216 234 0 87 126 115 100 80 50 10 18 142 205 39 1 50 89 43 115 186 49 143 299 72 0 6 29 5 0 166 0 5 0 30 30 56 15 53 119 7 0 18 12 55 0 2 11 2 7 1 Peribacillus frigoritolerans (SP56) 37 33 252 37 8 102 9 25 88 64 19 32 84 58 62 1 35 55 6 23 29 27 71 33 23 82 12 10 15 42 39 30 75 125 68 64 51 0 40 8 166 34 68 0 136 71 123 32 37 53 47 9 68 49 52 30 130 120 64 35 14 11 11 Rhodococcus qingshengii (SP57) 282 199 152 134 40 43 51 103 239 370 53 158 188 377 381 1 113 227 1 84 182 77 6 33 96 414 64 21 74 162 102 231 338 67 289 524 58 0 2 11 0 0 87 0 0 0 35 64 29 0 0 14 4 56 25 0 19 142 76 82 11 13 19 Streptococcus thoraltensis (SP58) 368 256 42 160 71 92 263 147 374 526 330 274 357 589 554 7 259 344 8 218 264 109 449 202 108 615 204 178 215 252 116 328 555 86 402 646 139 0 39 69 927 160 237 0 12 297 81 107 294 216 249 362 58 42 199 225 363 144 185 116 79 15 42 Streptococcus lactarius (SP59) 145 109 139 73 26 75 45 44 178 242 45 110 144 251 268 2 106 138 105 125 91 49 1 49 124 294 37 17 53 114 60 163 260 206 220 332 38 0 35 42 37 0 79 254 16 0 30 31 88 41 246 369 5 0 4 12 159 0 18 51 35 10 14 Acinetobacter pittii (SP6) 43 20 178 47 10 40 6 20 72 51 21 37 281 45 55 2 44 57 168 48 23 13 13 23 130 104 9 9 17 19 48 32 53 202 76 58 193 0 18 200 10 0 195 0 2 0 5 12 54 2 91 134 7 0 103 14 47 0 3 17 12 4 1 Actinidia eriantha (SP66) 334 223 33 198 66 92 259 146 403 577 562 305 27 618 643 0 312 391 231 231 243 130 186 253 296 691 221 182 250 298 163 426 611 334 440 799 0 0 64 46 461 73 0 9 20 142 61 88 207 145 405 545 36 0 84 130 283 19 74 56 84 16 21 Enterococcus casseliflavus (SP67) 366 266 327 230 70 145 76 153 445 608 525 335 258 666 680 0 315 398 7 181 262 89 156 309 127 672 102 24 111 291 148 342 549 334 490 770 84 0 44 58 371 46 148 236 148 123 153 129 189 113 342 404 64 178 154 110 350 493 236 211 73 71 58 Staphylococcus warneri (SP68) 134 83 133 158 28 69 22 41 156 199 327 124 204 219 211 200 262 198 143 125 130 45 178 226 133 205 42 15 58 116 41 128 173 46 150 273 150 14 64 37 322 70 200 0 152 128 161 54 155 97 236 244 80 148 191 107 280 371 210 173 125 214 83 Bradyrhizobium japonicum (SP69) 342 245 1 252 61 127 85 170 347 439 680 260 272 477 516 326 406 412 303 294 291 121 389 398 314 529 110 40 147 253 126 320 456 109 340 617 303 0 81 61 825 147 234 247 114 293 136 94 264 258 275 339 89 141 394 218 377 398 267 202 104 60 80 Staphylococcus pasteuri (SP7) 162 99 159 98 31 92 41 84 174 228 205 120 206 219 269 6 395 216 13 193 148 49 102 240 54 258 38 7 67 104 97 162 274 344 260 357 92 0 61 23 212 38 150 11 100 81 109 57 91 52 196 218 54 50 72 51 184 150 91 83 21 9 22 Acinetobacter johnsonii (SP70) 29 27 2 11 8 6 6 22 25 67 133 34 123 57 55 0 33 53 0 25 25 4 5 82 11 53 17 10 32 47 21 33 46 14 44 59 38 0 4 20 10 192 74 0 8 0 11 11 33 6 81 124 1 0 59 143 50 0 2 25 13 25 6 Enterobacter mori (SP71) 42 40 1 23 5 5 6 11 54 70 34 30 2 65 86 0 143 60 120 100 47 18 40 44 92 77 13 0 11 36 19 37 76 17 53 82 0 0 44 5 62 10 0 0 149 28 120 37 9 25 31 0 42 10 13 22 103 0 17 4 9 0 7 Tannerella serpentiformis (SP72) 41 33 22 26 41 48 17 33 44 59 142 37 87 65 55 0 175 60 131 107 65 29 4 123 103 56 13 66 4 29 13 22 36 13 42 70 26 0 6 15 2 0 50 0 3 0 3 10 20 6 69 117 2 0 4 35 24 0 3 70 9 2 1 Mammaliicoccus sciuri (SP73) 140 52 264 110 43 98 47 75 165 170 309 107 144 144 176 3 156 147 125 103 88 72 143 155 118 224 39 11 99 118 61 219 234 188 146 220 52 315 8 31 379 70 102 6 9 115 17 59 62 43 35 11 11 121 96 67 59 342 175 112 22 26 37 Shigella flexneri (SP74) 80 42 0 30 10 23 20 32 69 120 21 40 287 118 127 4 49 68 309 104 64 35 109 10 240 141 19 3 36 42 65 86 122 302 145 131 97 0 26 44 206 33 169 0 104 80 94 35 87 50 122 97 43 1 69 49 151 6 35 26 19 9 17 Corynebacterium kroppenstedtii (SP75) 100 96 94 36 14 16 22 40 107 144 281 82 98 156 182 0 120 105 2 42 48 31 6 129 27 166 26 11 23 67 42 99 152 25 112 208 41 0 0 27 0 0 71 635 0 0 17 18 46 81 3 16 0 30 20 0 18 108 47 45 4 6 8 Corynebacterium pilbarense (SP76) 69 57 239 102 15 162 34 179 168 112 382 94 123 122 104 264 132 111 4 45 57 36 159 147 44 132 24 26 27 42 66 79 141 279 172 145 227 0 80 70 268 37 135 754 187 88 139 62 154 163 300 323 60 5 40 59 303 5 47 62 33 11 23 Mammaliicoccus lentus (SP77) 76 68 0 50 7 13 30 34 88 142 175 73 12 143 146 0 92 100 278 117 60 29 80 83 199 173 38 9 44 74 45 74 138 149 110 195 0 0 22 10 179 16 0 0 124 47 45 124 97 38 141 155 17 0 96 62 120 0 23 31 25 37 9 Mediterraneibacter faecis (SP78) 60 39 0 17 17 14 12 16 69 94 39 36 230 97 106 4 137 61 11 85 43 27 48 69 29 97 26 0 14 37 29 51 87 22 49 114 72 6 41 36 84 17 157 254 77 103 104 48 74 34 86 96 54 76 54 24 84 124 55 40 45 24 44 Klebsiella michiganensis (SP79) 14 17 0 30 0 2 4 8 14 34 3 19 2 45 42 0 16 30 0 19 16 3 0 8 7 48 6 2 14 17 26 17 54 97 61 53 0 0 4 2 7 0 0 0 3 0 3 4 23 5 57 99 0 0 0 7 32 0 1 16 5 0 3 Escherichia fergusonii (SP8) 309 244 589 217 146 245 70 179 395 426 315 284 254 448 492 133 529 397 962 449 274 143 422 293 904 526 100 219 139 246 307 323 522 748 538 689 169 63 171 155 1409 231 230 62 115 369 124 251 318 254 428 434 112 53 209 286 375 132 178 146 105 24 54 Bifidobacterium bifidum (SP80) 25 14 0 6 7 5 12 16 22 32 5 24 133 49 35 0 9 40 165 67 15 10 72 21 97 52 17 3 30 39 16 29 36 11 20 58 51 0 46 13 174 27 69 0 295 50 166 135 51 55 86 87 66 169 122 55 208 426 201 165 42 67 49 Streptococcus chosunense (SP81) 33 28 0 23 5 11 11 13 31 46 155 34 250 48 55 1 43 37 15 19 28 58 146 76 11 66 18 7 40 39 20 143 126 14 33 84 102 13 27 36 483 77 154 0 8 116 8 50 87 92 110 158 23 0 113 70 90 7 51 22 25 3 19 Enterobacter kobei (SP82) 86 83 0 115 22 81 35 76 178 123 15 61 6 162 150 0 42 96 2 45 48 23 33 26 31 188 39 13 66 92 48 115 154 146 147 196 0 0 46 2 63 18 0 0 272 23 159 135 29 22 106 88 57 4 76 48 162 0 10 31 13 23 8 Massilia arenae (SP83) 83 55 33 43 54 69 34 46 82 87 65 83 154 126 116 1 83 122 8 40 51 31 184 32 17 123 18 75 21 41 32 64 117 178 95 160 37 0 24 36 366 54 80 494 7 134 18 24 135 140 144 205 38 40 76 71 158 125 80 55 36 20 33 Actinomyces sp. HMT525 (SP84) 16 10 0 2 3 0 2 5 14 19 5 16 4 25 25 0 10 20 0 8 13 1 0 4 6 30 9 0 1 14 4 18 27 8 18 27 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Lawsonella clevelandensis (SP85) 42 14 0 17 4 7 11 15 31 59 329 57 114 52 67 121 84 65 145 57 28 11 276 134 102 77 4 2 12 22 31 32 75 123 53 67 115 0 10 42 490 94 115 0 0 165 10 25 136 137 21 13 31 0 104 103 108 22 64 7 46 0 15 Sphingomonas leidyi (SP86) 38 34 0 27 16 6 11 13 51 114 11 42 395 98 85 6 38 49 189 73 40 32 187 5 137 127 18 1 31 30 54 51 94 225 102 88 164 0 9 53 345 57 295 0 0 147 5 18 91 70 12 40 18 0 83 84 45 0 47 4 26 2 10 Streptococcus oralis (SP87) 68 54 0 39 15 12 15 14 49 105 36 35 1 108 122 0 138 72 7 67 70 20 171 64 21 123 30 2 25 41 32 61 100 31 82 127 0 0 18 10 310 206 0 0 9 127 13 25 112 106 101 143 20 0 56 145 147 0 57 18 31 6 12 Streptococcus mutans (SP88) 103 63 0 59 18 32 21 40 112 124 65 50 15 137 186 111 475 127 20 183 117 94 158 168 36 207 36 3 29 74 62 110 167 268 200 215 93 0 21 50 367 53 41 260 6 126 16 103 250 111 151 203 35 0 53 87 144 0 63 21 25 225 14 Acinetobacter septicus (SP89) 19 16 0 17 1 8 4 5 14 35 3 15 86 48 42 0 34 34 3 11 16 12 80 9 7 72 13 3 12 19 24 24 47 148 125 50 38 0 24 25 162 26 67 0 15 70 2 14 51 35 141 135 10 39 32 39 116 118 68 59 37 190 32 Bacillus halotolerans (SP9) 177 151 348 123 43 137 44 103 283 269 627 172 493 250 310 149 366 390 150 160 140 60 221 337 212 383 86 27 80 153 165 182 220 52 210 453 243 287 108 49 484 110 377 0 88 167 101 52 176 162 232 250 81 83 150 105 256 247 228 125 58 52 46 Abiotrophia defectiva (SP90) 135 79 120 81 18 48 16 58 149 183 43 74 139 155 192 0 66 111 6 58 73 34 43 24 84 219 31 17 33 63 200 140 165 162 193 297 41 0 13 27 118 15 79 0 9 40 26 33 85 44 143 205 22 0 34 29 97 0 17 27 28 8 9 Acinetobacter radioresistens (SP91) 13 3 0 2 2 3 0 2 10 18 3 10 0 19 27 0 9 20 1 4 11 4 34 2 1 35 4 0 7 10 0 9 20 3 22 24 0 0 8 2 81 228 0 0 2 20 4 3 24 24 59 96 3 0 20 124 42 0 12 11 8 8 10 Staphylococcus saprophyticus (SP92) 12 34 0 10 9 5 3 11 15 32 1 18 18 35 40 137 13 22 0 29 29 19 9 32 10 33 12 8 20 47 23 22 44 120 43 59 56 0 0 0 0 0 37 0 0 0 8 4 15 0 0 0 7 45 96 15 6 107 53 48 5 36 9 Pseudoramibacter alactolyticus (SP93) 132 77 128 126 31 144 29 126 238 208 40 95 22 220 247 0 79 160 2 63 89 42 84 58 50 245 65 24 74 128 36 139 169 36 158 267 0 0 15 13 212 28 0 270 5 87 35 36 88 76 75 74 17 38 96 50 68 154 88 47 16 50 16 Corynebacterium appendicis (SP94) 14 11 0 12 5 4 6 16 22 43 6 13 2 38 48 0 20 12 0 11 18 13 0 9 6 53 8 0 5 14 4 29 26 9 27 48 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 4 4 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Corynebacterium pseudodiphtheriticum (SP95) 34 24 1 28 5 7 15 22 49 83 10 32 12 102 76 0 25 49 161 65 29 23 76 8 157 101 8 2 13 30 111 81 82 31 92 134 0 0 2 20 148 35 0 211 0 60 9 9 37 59 5 0 13 35 40 28 36 113 73 45 14 6 15 Robinsoniella peoriensis (SP96) 8 10 0 7 5 3 3 0 12 22 0 7 3 25 23 0 2 12 0 6 7 3 0 0 4 18 3 0 1 10 3 13 17 4 20 32 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Corynebacterium falsenii (SP97) 37 14 0 28 0 3 7 5 34 59 6 21 1 77 64 0 14 26 4 10 27 6 64 2 9 62 10 0 7 17 13 34 57 13 33 46 0 0 1 2 98 27 0 0 0 42 5 4 26 32 5 0 13 0 18 24 23 0 8 1 13 0 0 Lactiplantibacillus plantarum (SP98) 41 35 1 27 6 7 11 15 39 70 4 27 132 68 72 139 20 34 4 11 29 16 11 12 24 62 16 0 14 17 17 47 73 14 25 67 122 0 21 18 0 0 145 0 111 0 84 21 24 0 31 12 32 65 24 0 80 167 44 47 5 11 19 Prevotella sp. HMT314 (SP99) 132 93 0 50 27 19 30 42 143 211 26 90 138 235 245 1 59 129 8 59 83 31 93 29 49 244 40 4 35 100 51 143 182 30 160 292 39 0 28 28 209 31 98 0 11 66 32 41 89 74 147 266 24 0 51 67 167 0 41 33 28 10 9 Mammaliicoccus sciuri_nov_96.743% (SPN1) 0 0 0 17 0 3 3 10 4 0 0 2 0 0 4 0 2 1 0 3 5 1 0 3 0 10 2 5 4 0 22 4 17 130 27 3 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Faecalibaculum rodentium_nov_93.103% (SPN10) 2 6 0 6 4 0 1 3 9 16 2 10 1 19 22 0 6 6 0 3 6 0 0 2 2 20 3 0 5 8 4 8 16 6 11 27 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Olsenella phocaeensis_nov_91.977% (SPN11) 28 11 0 13 5 2 12 9 41 41 13 26 6 54 49 0 21 33 0 7 15 8 42 12 5 45 5 3 12 22 8 17 37 12 26 59 0 0 3 2 85 18 0 0 6 28 1 14 28 17 44 63 9 0 9 17 60 0 20 9 13 3 14 Anaerostipes caccae_nov_96.266% (SPN12) 11 17 0 7 1 4 3 3 8 10 2 4 1 18 17 0 2 19 0 3 6 2 0 5 2 21 1 0 3 3 0 13 11 1 14 17 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Longibaculum muris_nov_90.607% (SPN13) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25 8 0 0 0 0 92 10 0 39 15 0 0 43 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Corynebacterium matruchotii_nov_86.497% (SPN14) 17 2 0 6 2 2 4 2 6 27 7 14 0 17 16 0 7 7 0 5 9 2 0 0 0 16 3 0 0 5 1 4 14 1 6 26 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Limosilactobacillus reuteri_nov_93.571% (SPN15) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 35 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 79 5 0 0 0 20 0 2 10 24 3 0 6 0 11 10 8 0 9 0 5 0 3 Klebsiella pneumoniae_nov_91.098% (SPN16) 11 9 0 6 2 4 4 2 7 11 6 5 0 13 19 0 9 6 0 11 7 3 0 0 6 20 1 0 8 3 3 10 17 2 5 18 0 0 2 2 2 0 0 0 6 0 1 4 17 6 37 81 3 0 0 9 45 0 0 4 3 1 3 Zavarzinia aquatilis_nov_84.906% (SPN17) 1 0 0 1 0 3 0 7 4 0 0 4 0 0 4 0 5 2 1 1 7 0 33 0 0 6 0 0 6 0 16 1 10 113 29 1 0 0 5 4 64 7 0 0 0 32 0 0 8 11 0 0 4 0 13 12 6 0 18 2 8 0 4 Robinsoniella peoriensis_nov_94.563% (SPN18) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 69 7 0 0 0 29 0 5 11 18 0 0 8 0 7 16 14 0 12 1 5 0 0 Corynebacterium coyleae_nov_94.908% (SPN19) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 61 14 0 0 0 15 0 0 5 25 0 0 5 0 13 14 8 0 13 0 4 0 6 Fusobacterium nucleatum_nov_91.853% (SPN2) 14 11 0 11 6 4 0 2 21 32 2 7 85 33 31 0 9 16 4 16 15 7 5 0 9 42 6 1 5 10 8 27 31 7 32 44 37 0 0 14 0 0 60 0 0 0 7 2 7 0 0 5 0 0 12 0 0 0 0 0 0 0 0 Enterococcus faecalis_nov_95.255% (SPN20) 2 0 0 42 4 54 5 51 64 0 99 8 125 5 0 0 39 14 1 0 0 7 5 51 57 0 0 19 14 0 91 22 0 0 38 16 48 0 38 19 10 0 87 206 3 0 0 59 50 21 45 90 3 13 14 3 32 94 22 44 12 5 8 Ligilactobacillus murinus_nov_95.911% (SPN21) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 94 0 0 0 0 0 4 0 0 2 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28 0 0 9 0 0 69 0 0 0 0 0 3 0 0 10 0 0 7 0 0 0 0 0 0 0 0 Faecalibaculum rodentium_nov_91.098% (SPN22) 5 11 0 6 1 1 1 3 13 16 0 2 1 17 19 0 1 14 0 5 3 2 0 0 7 24 3 0 1 10 3 9 9 5 9 20 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 4 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Enterobacter mori_nov_89.749% (SPN23) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 66 0 0 0 0 0 3 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 0 48 0 0 22 0 0 64 0 0 0 0 0 3 0 0 11 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 Sediminibacterium roseum_nov_92.115% (SPN24) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 81 0 0 0 0 0 4 0 0 7 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41 0 0 8 0 0 58 0 0 0 0 0 8 0 0 10 0 0 7 0 0 0 0 0 0 0 0 Rheinheimera nanhaiensis_nov_86.051% (SPN25) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 0 0 0 191 0 0 0 0 5 22 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Corynebacterium falsenii_nov_91.304% (SPN26) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 3 14 0 0 0 2 0 0 2 18 3 53 74 4 0 0 2 26 0 4 10 3 0 2 Duncaniella freteri_nov_90.977% (SPN27) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 0 0 0 0 0 79 0 50 9 0 0 14 0 20 0 0 0 40 0 0 2 0 0 0 Bifidobacterium pseudolongum_nov_94.646% (SPN28) 13 11 0 8 2 5 4 2 4 15 3 3 1 18 26 0 3 14 0 5 7 1 0 3 1 12 1 0 3 8 8 8 9 4 9 17 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Lachnospiraceae_[G-11] bacterium_MOT-176_nov_95.136% (SPN29) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14 0 0 124 25 0 5 11 0 0 34 0 0 4 0 0 0 5 4 0 0 0 0 0 0 0 Turicibacter sanguinis_nov_95.437% (SPN3) 0 0 0 8 10 5 2 13 1 0 0 2 0 6 0 0 4 20 0 18 0 2 0 12 0 11 13 10 14 24 28 7 5 130 31 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 0 0 0 0 0 0 0 50 16 0 0 0 0 0 25 0 Kocuria indica_nov_94.872% (SPN30) 353 266 204 195 55 130 95 117 411 585 310 260 31 625 682 0 248 358 5 164 252 80 245 154 258 664 91 23 99 228 310 390 518 115 426 827 0 27 64 41 839 114 0 22 36 230 73 157 274 179 564 943 46 0 118 180 471 10 99 105 116 30 50 Phycocomes zhengii_nov_88.764% (SPN31) 37 12 14 15 6 13 57 12 23 23 3 4 1 32 28 0 9 10 0 9 8 13 0 1 6 29 33 60 41 21 2 19 25 8 22 21 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 8 5 0 0 0 0 0 35 0 0 0 0 0 0 0 0 Photobacterium frigidiphilum_nov_83.878% (SPN32) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 41 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 59 7 0 0 0 27 0 2 12 22 5 0 1 0 18 17 5 0 2 0 3 0 0 Streptococcus thoraltensis_nov_95.652% (SPN33) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 110 24 0 7 0 0 72 0 0 0 0 0 4 0 0 5 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Bradyrhizobium valentinum_nov_90.985% (SPN34) 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 111 10 0 0 0 0 32 17 0 0 0 0 0 49 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Adlercreutzia caecimuris_nov_92.843% (SPN35) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 7 62 9 0 0 0 21 0 3 16 13 5 0 7 0 12 14 6 0 6 0 5 0 0 Oscillospiraceae_[G-2] bacterium_MOT-149_nov_95.427% (SPN36) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 1 5 0 0 0 1 0 0 6 12 8 43 86 2 0 0 9 29 0 2 9 5 2 0 Cutibacterium avidum_nov_95.072% (SPN37) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 33 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51 18 0 0 0 19 0 0 11 12 0 0 12 0 14 31 12 0 5 0 3 0 2 Enterococcus gallinarum_nov_91.392% (SPN38) 13 10 0 6 1 1 5 1 5 21 0 4 2 14 7 0 3 12 0 4 11 2 0 0 2 25 3 0 1 7 2 11 12 5 13 18 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Granulicatella elegans_nov_84.142% (SPN39) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17 0 0 69 0 0 0 0 0 3 0 0 4 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30 0 0 15 0 0 67 0 0 0 0 0 4 0 0 4 0 0 8 0 0 0 0 0 0 0 0 Weizmannia ginsengihumi_nov_96.346% (SPN4) 8 8 0 6 2 3 1 5 9 11 2 4 0 16 16 0 7 16 0 7 11 2 0 0 5 11 1 0 3 3 8 14 18 2 12 22 0 223 0 0 0 0 0 0 0 0 1 15 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Eggerthella timonensis_nov_88.867% (SPN40) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 130 11 0 0 0 0 25 12 0 0 0 0 0 43 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Corynebacterium glyciniphilum_nov_88.528% (SPN41) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87 1 0 0 0 0 4 0 0 0 13 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 34 0 0 10 0 0 49 0 0 0 0 0 11 0 0 8 0 0 4 0 0 0 0 0 0 4 0 Enterococcus faecalis_nov_96.175% (SPN42) 17 17 0 12 2 9 4 9 24 37 7 23 0 41 37 0 15 20 1 11 18 1 45 5 7 62 16 1 7 15 19 35 48 120 61 43 0 0 2 6 76 26 0 0 0 41 1 7 16 25 2 0 4 0 13 19 17 0 99 57 78 0 36 Corynebacterium argentoratense_nov_95.850% (SPN43) 126 136 4 100 25 19 45 58 231 218 484 138 305 262 241 246 354 184 14 123 116 66 175 284 58 299 48 5 48 109 42 139 220 45 166 265 191 0 24 56 342 81 269 340 186 116 54 181 146 100 123 166 23 0 83 90 116 4 56 36 30 6 36 Daejeonella oryzae_nov_85.551% (SPN44) 231 171 1 100 29 34 50 66 233 314 37 143 32 372 374 194 121 197 0 91 176 123 3 32 67 390 67 5 54 137 65 221 312 87 232 419 101 0 114 40 0 0 54 0 0 0 39 47 163 0 0 0 10 238 21 1 46 617 271 175 18 45 56 Thermodesulfobium acidiphilum_nov_81.729% (SPN45) 79 60 0 53 20 24 24 33 84 151 209 73 459 146 125 182 118 118 698 213 52 74 185 110 568 163 37 19 45 92 60 90 143 68 116 190 243 0 237 60 283 42 354 0 6 108 27 44 166 76 153 240 33 49 200 92 168 119 110 68 39 47 173 Arthrospira platensis_nov_88.987% (SPN46) 113 137 0 80 94 33 34 81 150 204 23 83 257 236 233 0 81 135 12 89 93 50 62 67 44 221 54 159 83 134 112 135 233 528 261 253 106 0 10 28 114 30 164 0 0 39 16 33 51 23 0 19 6 43 128 42 32 146 84 69 9 42 18 Sporosarcina sp._MOT-205_nov_96.360% (SPN47) 141 106 1 72 19 31 28 50 146 266 35 100 93 226 252 0 93 175 2 80 92 57 76 54 42 287 62 14 74 126 60 132 256 198 195 334 53 0 8 16 101 17 104 0 135 45 55 130 54 26 82 132 13 52 89 48 65 140 65 65 19 40 19 Brevibacterium paucivorans_nov_97.368% (SPN48) 45 141 107 17 21 8 21 112 80 14 334 55 208 24 19 1 83 69 14 38 10 30 97 149 5 38 11 11 52 70 60 15 64 272 122 35 87 0 64 29 204 19 144 0 174 50 164 37 95 49 350 400 76 122 119 84 338 366 167 189 45 57 50 Streptococcus danieliae_nov_95.594% (SPN49) 92 116 212 70 21 44 24 73 113 145 215 73 268 122 127 117 302 136 5 132 96 52 83 172 26 137 43 22 39 92 61 52 133 302 149 142 231 0 226 63 165 22 260 597 232 61 206 39 114 126 151 107 55 43 102 48 183 145 87 68 26 35 136 Mediterraneibacter glycyrrhizinilyticus_nov_95.367% (SPN5) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 0 0 137 13 0 0 20 0 0 42 0 0 6 0 0 0 6 17 0 0 0 0 0 0 0 Clostridium saccharoperbutylacetonicum_nov_95.800% (SPN50) 55 36 0 42 11 13 17 36 55 83 149 53 292 72 101 0 69 71 148 68 48 37 55 69 163 109 20 7 30 40 189 84 123 288 170 128 130 0 38 59 96 12 255 16 74 40 70 18 85 24 90 122 38 7 55 29 103 0 19 15 9 8 5 Microbacterium saccharophilum_nov_76.981% (SPN51) 80 34 0 31 9 17 17 36 75 113 15 44 6 107 150 0 50 71 136 61 56 13 263 14 184 143 23 0 18 45 136 81 101 35 107 182 0 0 8 1 492 235 0 0 3 175 18 27 76 115 7 0 36 0 81 178 94 5 57 7 26 0 19 Ligilactobacillus murinus_nov_97.020% (SPN52) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17 0 66 8 0 0 83 29 44 5 11 41 24 0 24 4 14 14 70 0 119 89 77 0 45 Duncaniella freteri_nov_90.075% (SPN53) 25 18 0 24 4 4 10 10 34 50 5 20 2 47 52 0 24 33 2 8 33 5 51 10 15 53 5 0 11 29 11 38 51 8 45 66 0 0 1 3 126 25 0 0 0 38 3 7 23 25 6 0 11 0 13 11 16 5 12 0 5 0 0 Ralstonia solanacearum_nov_95.922% (SPN54) 64 27 125 34 11 55 11 20 86 69 29 23 85 93 75 2 26 48 2 17 38 14 4 12 13 83 10 4 13 30 15 45 44 18 52 97 41 0 19 14 12 0 67 0 4 0 4 14 60 9 129 157 12 33 11 20 91 125 48 57 24 26 15 Frankia discariae_nov_81.481% (SPN55) 14 8 0 9 0 2 3 5 19 24 138 17 2 24 22 0 34 38 0 8 9 1 33 51 5 18 7 0 4 10 5 20 19 6 17 18 0 0 40 11 130 20 0 9 4 32 2 18 73 37 174 272 9 0 19 38 141 0 25 36 30 10 17 Ligilactobacillus murinus_nov_96.667% (SPN56) 11 5 0 2 3 4 6 7 11 17 6 9 0 19 12 0 16 9 0 4 2 5 0 0 0 18 1 1 7 3 7 8 23 0 11 13 0 0 34 5 9 0 0 0 84 0 65 21 29 4 119 157 24 5 0 12 110 0 3 18 10 2 4 Faecalibaculum rodentium_nov_96.571% (SPN57) 11 5 0 5 3 2 7 5 17 11 0 10 2 28 30 0 3 15 0 4 8 6 0 4 5 19 1 0 6 6 3 10 23 5 15 35 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 2 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Lactobacillus gasseri_nov_94.075% (SPN58) 23 17 0 7 4 8 2 2 19 28 5 15 1 29 34 0 13 25 0 17 16 10 0 7 12 30 3 4 7 20 5 20 28 7 17 56 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 5 4 7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Enterococcus faecalis_nov_94.118% (SPN59) 11 7 0 3 2 6 2 2 9 20 0 3 0 34 16 0 3 6 0 3 12 2 0 3 3 21 1 0 8 5 5 6 11 2 10 14 0 11 0 1 119 18 0 10 128 0 24 131 1 0 13 0 0 0 6 12 0 0 0 9 0 0 0 Streptococcus thoraltensis_nov_94.361% (SPN6) 7 9 0 3 2 1 1 3 14 18 0 9 0 24 27 0 4 7 0 4 13 2 0 2 3 22 5 0 1 11 2 11 11 4 17 18 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Cutibacterium acnes_nov_94.643% (SPN7) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 206 0 0 0 0 6 15 0 0 2 27 2 0 6 102 44 30 4 12 7 Prauserella oleivorans_nov_80.113% (SPN8) 19 7 105 37 7 36 54 18 41 13 120 21 1 27 19 0 43 50 0 24 11 7 0 78 5 34 26 72 48 34 0 7 20 1 6 34 0 0 0 15 0 0 0 0 0 0 4 0 3 0 3 0 0 48 47 16 7 91 37 26 3 22 12 Enterococcus faecalis_nov_96.685% (SPN9) 8 7 0 5 3 4 0 3 10 29 0 6 1 15 24 0 7 7 0 2 16 1 0 4 3 10 0 0 1 6 2 7 16 7 16 19 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 1 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Bradyrhizobium multispecies_spp1_2 (SPP1) 13 6 0 7 2 1 4 2 17 25 3 6 2 22 18 0 6 7 0 2 4 1 0 0 0 18 3 0 6 5 5 7 21 3 18 29 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 3 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Staphylococcus multispecies_spp2_3 (SPP2) 5718 3787 116 2800 906 1089 1226 1967 6166 9367 1590 3826 1424 9850 11110 15 4082 5247 813 3083 4368 1315 1901 1360 2551 11334 1749 132 1711 3839 1970 5897 9654 2819 6951 13088 377 0 463 375 3799 850 734 786 1218 1434 1979 1598 1451 1122 1662 2288 607 891 791 1043 2501 2106 1580 976 561 199 389 Staphylococcus multispecies_spp3_2 (SPP3) 14 12 0 6 2 0 3 3 12 11 3 6 0 18 17 0 1 10 0 2 13 3 0 1 2 11 3 0 9 3 2 13 16 2 9 20 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 multigenus multispecies_spp4_2 (SPP4) 56 39 0 39 17 14 31 32 96 98 164 67 8 130 130 0 68 77 1 42 51 18 77 73 23 151 48 6 47 67 16 76 123 29 82 165 0 0 2 26 152 20 0 0 0 158 29 24 54 28 9 0 8 64 37 34 42 105 71 32 36 10 45 Streptococcus multispecies_spp5_2 (SPP5) 76 36 0 51 10 16 15 19 90 114 253 74 418 129 137 5 85 80 12 36 53 27 105 82 25 116 23 2 24 53 32 74 107 22 72 186 116 0 92 87 277 48 280 274 28 75 15 41 250 142 635 946 48 40 103 118 424 138 126 159 100 53 44 Bacillus multispecies_spp6_6 (SPP6) 103 32 151 34 14 48 60 28 71 69 603 96 184 68 92 4 282 113 144 123 62 25 252 273 89 93 72 57 61 49 40 50 83 129 95 97 77 0 89 48 522 273 153 0 52 184 84 59 253 165 493 654 73 7 92 272 389 11 152 312 79 29 37 Staphylococcus multispecies_sppn1_3_nov_95.362% (SPPN1) 4 0 113 8 1 27 3 11 12 0 4 9 81 0 0 3 9 6 2 0 0 4 6 13 0 0 0 1 0 5 1 0 0 0 0 0 28 0 0 11 0 0 71 0 0 0 0 0 14 0 0 6 0 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 Staphylococcus multispecies_sppn2_3_nov_96.987% (SPPN2) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 0 0 0 0 0 79 11 10 19 0 0 0 6 19 30 0 0 0 0 0 19 3 27 Terrimonas multispecies_sppn3_2_nov_90.822% (SPPN3) 75 57 4 40 13 33 47 32 71 90 15 40 10 96 136 0 47 65 0 28 50 23 0 9 25 121 43 13 27 45 36 74 94 24 68 152 0 0 45 56 17 0 0 807 214 0 101 107 88 103 196 331 26 8 0 25 155 0 9 49 23 6 10 Gloeobacter multispecies_sppn4_2_nov_84.254% (SPPN4) 46 41 3 14 2 6 11 17 34 85 9 39 209 78 88 259 20 31 8 20 33 18 16 5 27 71 20 1 14 28 14 31 87 23 36 115 210 0 2 28 0 0 219 0 0 0 1 9 27 0 0 24 2 139 42 0 32 449 170 154 13 35 41